More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1956 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1956  response regulator receiver protein  100 
 
 		 396 aa  800    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.942882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 143 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  21.2 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  23.62 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  27.96 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  22.58 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  25.81 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  22.5 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2746  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 1096 aa  73.9  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  29.84 
 
 		 1177 aa  73.2  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  32.11 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 911 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  29.75 
 
 		 132 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1421  response regulator receiver protein  24.66 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0650838  normal  0.210106 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 941 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 452 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 934 aa  70.1  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  28.46 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5086  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.55 
 
 		 465 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  30.91 
 
 		 121 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2997  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 150 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 1832 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1139  response regulator receiver  31.19 
 
 		 121 aa  68.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 132 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1406  response regulator receiver protein  28.83 
 
 		 121 aa  68.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0894387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  34.17 
 
 		 121 aa  67.8  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  23.01 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0718  response regulator receiver protein  26.01 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  23.21 
 
 		 405 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4952  response regulator receiver protein  28.83 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.27 
 
 		 941 aa  67  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  33.03 
 
 		 123 aa  67  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 707 aa  66.6  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 452 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  31.06 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3187  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3139  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.36 
 
 		 676 aa  66.6  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0337  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 139 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 407 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.13 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 120 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  31.06 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.24 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  29.57 
 
 		 190 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3616  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159723  normal  0.789101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1274 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  25 
 
 		 1127 aa  65.1  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2330  response regulator receiver domain-containing protein  30.33 
 
 		 124 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  25.41 
 
 		 131 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2695  response regulator receiver domain-containing protein  29.51 
 
 		 186 aa  65.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00269866  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2738  response regulator receiver domain-containing protein  31.25 
 
 		 194 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000186206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4284  response regulator receiver protein  25.29 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0427  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  21.67 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  25.41 
 
 		 131 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1874  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.420153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0902  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.39 
 
 		 718 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.651526  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  29.36 
 
 		 137 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  30.3 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  31.43 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4344  response regulator receiver protein  24.71 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0880263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  30.84 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  29.84 
 
 		 925 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  29.41 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  30.17 
 
 		 925 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1128 aa  64.3  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0608  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.62 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0447  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  31.62 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  25 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 		 643 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0722  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  31.78 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.84817e-16 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 755 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 1907 aa  63.9  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  29.82 
 
 		 1888 aa  63.9  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  30.56 
 
 		 2092 aa  63.5  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0897  response regulator receiver domain-containing protein  26.23 
 
 		 131 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  25.68 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0765  response regulator receiver protein  31.19 
 
 		 130 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.474534  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  30.3 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 989 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  27.97 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 989 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1010  chemotaxis protein CheY  30.63 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1193  CheA signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 706 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0440291  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  28.83 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>