More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2735 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2735  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 87 aa  175  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.382705  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3672  transcriptional regulator, LuxR family  75.9 
 
 		 90 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2031  LuxR family transcriptional regulator  72.5 
 
 		 91 aa  125  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0483  LuxR family transcriptional regulator  68.67 
 
 		 87 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0293  transcriptional regulator, LuxR family  64.44 
 
 		 100 aa  120  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0499337  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2264  LuxR family transcriptional regulator  75.71 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.537119 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4179  transcriptional regulator, LuxR family  63.95 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4139  transcriptional regulator, LuxR family  63.95 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26831  LuxR transcriptional regulator  54.32 
 
 		 92 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  55 
 
 		 90 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01701  LuxR family regulatory protein  58.11 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  54.55 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2406  LuxR family transcriptional regulator  61.43 
 
 		 92 aa  98.2  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0287  LuxR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 92 aa  97.1  6e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01821  LuxR family regulatory protein  55.41 
 
 		 92 aa  97.1  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0156  LuxR family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.749313  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01711  LuxR family regulatory protein  55.41 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01731  LuxR family regulatory protein  55.41 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 216 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 216 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 212 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 215 aa  73.6  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 225 aa  70.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  46.27 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 218 aa  70.1  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  55.93 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.24 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.24 
 
 		 219 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.45 
 
 		 229 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 768 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  45.71 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.76 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4304  response regulator receiver  45.71 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.894661  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.76 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2033  LuxR family DNA-binding response regulator  45.71 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  50 
 
 		 418 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 229 aa  64.3  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1734  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.48 
 
 		 188 aa  63.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 245 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 217 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  46.27 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2836  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  43.28 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.71 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 303 aa  62  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 245 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3030  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 250 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2735  response regulator receiver  42.42 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0572845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 216 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3046  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.826568  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 245 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  48.28 
 
 		 213 aa  60.8  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2437  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 220 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 249 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 219 aa  60.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6306  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 209 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0259699  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1154  transcriptional regulator, LuxR family  45.31 
 
 		 386 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 234 aa  60.5  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 214 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 211 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 217 aa  60.5  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  49.09 
 
 		 776 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1561  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6596  two component LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  50.88 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2948  response regulator receiver protein  55.36 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  47.46 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  47.46 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  47.46 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  45.45 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0565  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0560  transcriptional regulator, LuxR family protein  50 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>