More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1154 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1154  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 386 aa  743    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.43 
 
 		 235 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.1 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.38 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  56.67 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  48.48 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.62 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4530  two component LuxR family transcriptional regulator  55 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5613  transcriptional regulator, LuxR family  45.26 
 
 		 238 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  44.62 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.49 
 
 		 216 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.49 
 
 		 216 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1006  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 219 aa  68.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.31 
 
 		 216 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  49.23 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  49.23 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  53.33 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5955  two component LuxR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.79 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.79 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  53.33 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  59.32 
 
 		 937 aa  67.4  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  53.33 
 
 		 215 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  53.33 
 
 		 215 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  46.88 
 
 		 471 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 243 aa  67  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 226 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 226 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 227 aa  67  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 233 aa  67  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  45.9 
 
 		 209 aa  67  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  49.21 
 
 		 231 aa  67  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  53.33 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  53.33 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  53.33 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  53.33 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  53.33 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0644  response regulator receiver domain protein  28.62 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.520039 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 231 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  45.9 
 
 		 222 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  52.54 
 
 		 209 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  52.54 
 
 		 209 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  52.54 
 
 		 209 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 454 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  52.54 
 
 		 209 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 209 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 242 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 242 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  43.53 
 
 		 217 aa  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 		 970 aa  66.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  50.79 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.79 
 
 		 204 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 215 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  44.44 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  44.44 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1104  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  46.67 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  47.69 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2045  LuxR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 547 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3804  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.38 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.185264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  52.38 
 
 		 982 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1686  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173725  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  38.04 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 508 aa  63.5  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  47.62 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2079  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2223  transcriptional regulator NarL  42.65 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134159  normal  0.207388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2299  transcriptional regulator NarL  42.65 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.590018  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  55 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3277  transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>