More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3634 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 525 aa  1048    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3826  transcriptional regulator, LuxR family  53.31 
 
 		 519 aa  421  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3310  regulatory protein, LuxR  47.14 
 
 		 512 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2058  metal dependent phosphohydrolase  48.03 
 
 		 521 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4288  metal dependent phosphohydrolase  47.24 
 
 		 519 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.472516  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 526 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  47.92 
 
 		 526 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  45.1 
 
 		 516 aa  389  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  47.52 
 
 		 526 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0321  transcriptional regulator, LuxR family  47.87 
 
 		 524 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  35.7 
 
 		 450 aa  229  9e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  34.16 
 
 		 448 aa  229  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1505  transcriptional regulator, LuxR family  34.1 
 
 		 522 aa  223  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6457  LuxR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 570 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6692  LuxR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 570 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6289  LuxR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 515 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5833  LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 489 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2752  metal-dependent phosphohydrolase  35.08 
 
 		 456 aa  210  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204771  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  33.93 
 
 		 461 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  33.71 
 
 		 461 aa  202  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0229  putative metal dependent phosphohydrolase  33.53 
 
 		 474 aa  192  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  29.52 
 
 		 460 aa  190  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0009  metal dependent phosphohydrolase  26.96 
 
 		 405 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  29.67 
 
 		 347 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  34 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  25.87 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  33.01 
 
 		 420 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  36.19 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  32.74 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0297  metal dependent phosphohydrolase  29.62 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  31.51 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  38.86 
 
 		 698 aa  123  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  40.23 
 
 		 713 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0891  metal dependent phosphohydrolase  34.03 
 
 		 439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1640  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 		 471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 		 389 aa  120  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2407  HD domain-containing protein  32.51 
 
 		 415 aa  120  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00855664  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  34.21 
 
 		 421 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  38.86 
 
 		 405 aa  117  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 		 424 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  38.29 
 
 		 710 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  31.11 
 
 		 417 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  33.87 
 
 		 770 aa  116  8.999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  40.7 
 
 		 1171 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  36.84 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 		 371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  40.67 
 
 		 848 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0697  metal dependent phosphohydrolase  33.89 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.06 
 
 		 480 aa  114  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 		 635 aa  114  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  34.3 
 
 		 452 aa  114  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  32.3 
 
 		 547 aa  114  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  32.3 
 
 		 547 aa  114  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  32.71 
 
 		 418 aa  113  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  37.7 
 
 		 212 aa  113  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.36 
 
 		 841 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.99 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  38.41 
 
 		 550 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0342  metal dependent phosphohydrolase  28.7 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  34.87 
 
 		 876 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 		 425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.2 
 
 		 513 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  34.9 
 
 		 422 aa  111  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 		 446 aa  111  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 		 574 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  32.26 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  37.21 
 
 		 792 aa  110  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  34.5 
 
 		 648 aa  110  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 492 aa  110  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.14 
 
 		 384 aa  110  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  39.18 
 
 		 619 aa  110  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  36.2 
 
 		 339 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1338  metal dependent phosphohydrolase  42.95 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.427381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  35.39 
 
 		 359 aa  109  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2457  metal dependent phosphohydrolase  37.95 
 
 		 358 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  37.21 
 
 		 836 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0208  metal dependent phosphohydrolase  36.45 
 
 		 229 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  36.6 
 
 		 650 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  36.81 
 
 		 771 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  35.81 
 
 		 740 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  37.2 
 
 		 1237 aa  107  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  34.48 
 
 		 649 aa  107  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 		 387 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1793  metal dependent phosphohydrolase  34.57 
 
 		 298 aa  106  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000123225  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  34.3 
 
 		 422 aa  106  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  37.29 
 
 		 311 aa  106  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  37.65 
 
 		 177 aa  106  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 		 553 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 		 363 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 548 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  37.65 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 		 434 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  34.42 
 
 		 465 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2855  HDIG  28.67 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  35.98 
 
 		 571 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  38.27 
 
 		 334 aa  105  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.08 
 
 		 367 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 334 aa  105  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>