More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0633 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0633  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  455  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2948  response regulator receiver protein  67.58 
 
 		 221 aa  315  5e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3945  LuxR family transcriptional regulator  67.58 
 
 		 221 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00801334  normal  0.811932 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3887  LuxR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 221 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000207134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0560  transcriptional regulator, LuxR family protein  66.51 
 
 		 222 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3194  LuxR family transcriptional regulator  67.45 
 
 		 220 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0232917  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3096  regulatory protein, LuxR  62.39 
 
 		 222 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.735562  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0875  LuxR family transcriptional regulator  63.01 
 
 		 221 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0840  response regulator receiver protein  62.56 
 
 		 221 aa  299  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3500  response regulator receiver protein  62.56 
 
 		 249 aa  297  7e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0863  transcriptional regulator, LuxR family  61.64 
 
 		 221 aa  297  9e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3414  LuxR family transcriptional regulator  63.01 
 
 		 221 aa  296  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.295313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0720  LuxR family transcriptional regulator  62.56 
 
 		 221 aa  295  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0333677  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0864  LuxR family transcriptional regulator  61.99 
 
 		 255 aa  292  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3302  LuxR family transcriptional regulator  62.56 
 
 		 221 aa  291  4e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3137  response regulator receiver protein  61.84 
 
 		 209 aa  279  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0644  LuxR family transcriptional regulator  57.99 
 
 		 221 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140532  unclonable  0.00000001613 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01507  putative transcriptional regulator, LuxR family protein  41.09 
 
 		 159 aa  91.3  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.993499  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3306  LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0287  LuxR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1053  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06533  hypothetical protein  30.68 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2905  transcriptional regulator, LuxR family  36.96 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2858  probable CsgAB operon transcriptional regulatory protein  30.28 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.256874  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3704  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0339608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05153  hypothetical protein  35.34 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3355  two component LuxR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  30.07 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001276  transcriptional regulator VpsT  34.13 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  33.91 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  35.07 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 217 aa  72  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2814  LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002362  DNA-binding HTH domain-containing protein  23.98 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0501055  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  34.59 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0782  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03706  hypothetical protein  24.04 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.62 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.88 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2620  response regulator receiver protein  31.85 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.649971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.08 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1635  LuxR family two component transcriptional regulator  28.12 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2730  response regulator receiver  32.76 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.776601  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4082  two component LuxR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4688  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.78 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1237  two component LuxR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0707  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.65 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2554  two component LuxR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.958854  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0250  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.57 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.664516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  30.17 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2721  two component LuxR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1238  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  33.91 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1253  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  33.91 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.705931 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  53.23 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0287  LuxR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  30.17 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.71 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01037  DNA-binding transcriptional activator in two-component regulatory system  33.91 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1531  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.3 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1208  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  33.91 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316434  normal  0.419874 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0670  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.998369  normal  0.706802 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2406  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 92 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.07 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0043  two component LuxR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01044  hypothetical protein  33.91 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2048  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  33.91 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0804096  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2231  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  33.91 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.750523  normal  0.99411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01821  LuxR family regulatory protein  55.36 
 
 		 92 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0280  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.1 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417338  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2605  transcriptional regulator, LuxR family  33.91 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.196673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.66 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04820  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.71 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.28 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0156  LuxR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 92 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.749313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6049  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.11 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1158  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  33.91 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.354651  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.88 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2076  response regulator receiver protein  27.66 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2559  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  33.91 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.980478  normal  0.382247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0272  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.21 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.353555  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2497  two component LuxR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000315398  normal  0.0281112 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01711  LuxR family regulatory protein  55.36 
 
 		 92 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  51.61 
 
 		 90 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01731  LuxR family regulatory protein  55.36 
 
 		 92 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4648  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  30.25 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.21 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0728  two component LuxR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0866  two component LuxR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.54 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>