More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2497 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2497  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000315398  normal  0.0281112 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  67.69 
 
 		 240 aa  301  6.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5980  two component LuxR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 245 aa  189  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3589  two component LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  0.0443312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2880  two component LuxR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 219 aa  135  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2723  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.85 
 
 		 221 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2334  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.85 
 
 		 221 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.477601  normal  0.267999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2455  response regulator VSRC transcription regulator protein  36.92 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2742  LuxR response regulator receiver  38.39 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3356  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.334369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.05 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0261  two component LuxR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.574059  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0290  response regulator receiver protein  35.32 
 
 		 210 aa  96.3  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1932  DNA-binding response regulator  30.88 
 
 		 219 aa  95.1  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00601791  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.34 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.173401  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 215 aa  92  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 218 aa  91.7  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02404  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  32.86 
 
 		 218 aa  92  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0522  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38490  Response regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 215 aa  90.1  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2188  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.58 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.546074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1870  two component LuxR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1558  response regulator receiver  31.58 
 
 		 221 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2275  LuxR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0866  two component LuxR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 220 aa  89  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 206 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1495  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194449  normal  0.395611 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.41 
 
 		 236 aa  88.6  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.37 
 
 		 204 aa  88.2  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  33.66 
 
 		 213 aa  88.2  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0264  two component LuxR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4027  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.52 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0029  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.83 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0011  two component LuxR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2525  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.41 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002211  transcriptional regulator LuxR family  30.99 
 
 		 209 aa  86.7  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1237  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317123 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  32.52 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2245  two component LuxR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 218 aa  86.3  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00227369  normal  0.0543921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920509 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 207 aa  85.9  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.43 
 
 		 209 aa  85.5  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2039  two component LuxR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2648  LuxR family DNA-binding response regulator  31.19 
 
 		 220 aa  85.5  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 213 aa  85.1  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 209 aa  85.1  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0709  two component LuxR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 224 aa  85.1  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2836  two component LuxR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 207 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644859  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1635  LuxR family two component transcriptional regulator  33.02 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3716  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.576881  normal  0.099275 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4082  two component LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4737  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0133592 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.7 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4024  two component LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136895 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1568  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.51 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  30.29 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.99 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2130  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.19 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1537  putative two-component response regulator  33 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.85 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17670  LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.306063  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  30.24 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00157  transcriptional regulator LuxR  30.37 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0664  two component LuxR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.358413 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1663  two component LuxR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0154836  unclonable  0.0000152825 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2786  two component LuxR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0443035  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7667  two component LuxR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3954  two component LuxR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  30.1 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.41 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3283  two component LuxR family transcriptional regulator  29 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.335218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  31.07 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  30.24 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.59 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0618082  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.15 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0465  two component transcriptional regulator  29.67 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.03 
 
 		 216 aa  81.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  28.64 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  30.24 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3170  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  30 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1732  two component LuxR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0049943  normal  0.183248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  31.92 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  30.24 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  30.24 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  30.24 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1766  transcriptional regulator NarL  30.14 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0331  LuxR family DNA-binding response regulator  31.22 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  30.24 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>