More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2742 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2742  LuxR response regulator receiver  100 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2880  two component LuxR family transcriptional regulator  94.52 
 
 		 219 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2334  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.36 
 
 		 221 aa  301  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.477601  normal  0.267999 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2723  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.36 
 
 		 221 aa  301  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2455  response regulator VSRC transcription regulator protein  65.9 
 
 		 221 aa  301  7.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 240 aa  141  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5980  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2497  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000315398  normal  0.0281112 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3954  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0465  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  114  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3589  two component LuxR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 210 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  0.0443312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0264  two component LuxR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1574  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347453 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1151  two-component response regulator  36.04 
 
 		 248 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0625  two component LuxR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 221 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793996  hitchhiker  0.00440064 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1182  two component LuxR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192356 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2689  two component LuxR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2130  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.02 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2921  two component LuxR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190475 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3716  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.576881  normal  0.099275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0852  two component LuxR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1537  putative two-component response regulator  35.05 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1543  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.35 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17670  LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1237  two component LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317123 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  34.48 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38490  Response regulator, LuxR family  35.47 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4024  two component LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136895 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4027  DNA-binding response regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2061  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.15 
 
 		 224 aa  101  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.91 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1635  LuxR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4082  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02404  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  34.98 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7667  two component LuxR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4565  two component LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2408  two component LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 219 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0426941  normal  0.882432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4737  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.66 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0133592 
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  32.59 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5839  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 198 aa  99  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.242407  hitchhiker  0.00194364 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  34.27 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  32.59 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0565  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0836  LuxR family two component transcriptional regulator  34.5 
 
 		 224 aa  98.6  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0588074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4822  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 223 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0029  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.65 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0011  two component LuxR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3356  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.334369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0261  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.574059  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920509 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0290  response regulator receiver protein  35 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  38.42 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2188  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.81 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.546074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1932  two component LuxR family transcriptional regulator  31 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1571  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2941  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 251 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0273  two component LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 231 aa  94.7  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.173401  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0443  two component LuxR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2275  LuxR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  33.04 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.7 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.34 
 
 		 231 aa  93.2  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.19 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02155  putative regulator in two-component regulatory system ; LuxR family protein  29.22 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4192  two component transcriptional regulator, LuxR family  33 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.270399  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.99 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0920  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.65 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491034  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0164  two component LuxR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.55 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2591  two component LuxR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 235 aa  92.8  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211381  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2721  two component LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4344  two component LuxR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218307 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2076  response regulator receiver protein  30.41 
 
 		 238 aa  92.4  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  33 
 
 		 213 aa  92  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1766  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 203 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00488071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1249  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0647  two component LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 225 aa  91.7  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 		 217 aa  91.7  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  35.78 
 
 		 239 aa  91.7  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2003  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.21 
 
 		 219 aa  91.7  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183245  hitchhiker  0.00373502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  34.3 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2786  two component LuxR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0443035  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0694  two component LuxR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.770061  normal  0.351457 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3975  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0482097  normal  0.237128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.21 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0341  two component LuxR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1545  two component LuxR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5633  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.69 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.603295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.71 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>