More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2689 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2689  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5839  two component LuxR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.242407  hitchhiker  0.00194364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4704  DNA-binding response regulator CorR  43.2 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920509 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7667  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 209 aa  134  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1543  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.16 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0264  two component LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3229  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4854  putative two component LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0625  two component LuxR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793996  hitchhiker  0.00440064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2039  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0866  two component LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0991  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0694  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.770061  normal  0.351457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0836  LuxR family two component transcriptional regulator  39.51 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0588074 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0522  response regulator receiver protein  35.47 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1574  two component LuxR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347453 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4822  two component LuxR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.26 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0164  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4565  two component LuxR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0920  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.05 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491034  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3170  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  33.5 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0852  two component LuxR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1635  LuxR family two component transcriptional regulator  36.45 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.03 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.306063  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4082  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0664  two component LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.358413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0011  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 214 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3283  two component LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 223 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.335218 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0029  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 214 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4024  two component LuxR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 216 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136895 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0584  two component response regulator  34.31 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4737  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.32 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0133592 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2275  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1237  two component LuxR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317123 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3716  two component LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.576881  normal  0.099275 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.8 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  35.55 
 
 		 207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4027  DNA-binding response regulator, LuxR family  35.35 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3355  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.03 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.687232  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0091  two component LuxR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 214 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0331  LuxR family DNA-binding response regulator  37.86 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1571  XRE family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  35.94 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0315  LuxR family DNA-binding response regulator  37.86 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  35.27 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  34.85 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2742  LuxR response regulator receiver  38.54 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002211  transcriptional regulator LuxR family  34.36 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2880  two component LuxR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2606  two component LuxR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00642184  hitchhiker  0.00275886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1182  two component LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2493  two component LuxR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00157  transcriptional regulator LuxR  33.33 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.637953  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02404  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  37.88 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2665  LuxR family two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 221 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107491  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2648  LuxR family DNA-binding response regulator  32.51 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1858  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.66 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00870294  decreased coverage  0.00000000166193 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  39.33 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0290  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2173  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2076  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2941  two component LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1545  two component LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 219 aa  105  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1762  two component LuxR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1537  putative two-component response regulator  34.74 
 
 		 217 aa  104  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2305  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  30.66 
 
 		 220 aa  104  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17670  LuxR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 217 aa  104  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  37.29 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2408  two component LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0426941  normal  0.882432 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  37.29 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3138  two component LuxR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892266 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  37.29 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  37.29 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0408  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38490  Response regulator, LuxR family  34.65 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>