More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4704 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4704  DNA-binding response regulator CorR  100 
 
 		 199 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5839  two component LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 198 aa  147  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.242407  hitchhiker  0.00194364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2689  two component LuxR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920509 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.21 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  32.55 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0264  two component LuxR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4854  putative two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  104  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  31.92 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  32.08 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  32.08 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  32.08 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  32.08 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  32.08 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  32.08 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38490  Response regulator, LuxR family  38.05 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  32.08 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0164  two component LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 248 aa  101  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  30.96 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2275  LuxR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  33.33 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1537  putative two-component response regulator  35.78 
 
 		 217 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.05 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  37 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 		 209 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17670  LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 217 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.18 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4027  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.18 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 233 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  34 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00157  transcriptional regulator LuxR  34.17 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.96 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 237 aa  99  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  29.47 
 
 		 207 aa  97.8  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 207 aa  97.8  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3507  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.892641  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.34 
 
 		 228 aa  97.1  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0584  two component response regulator  32.24 
 
 		 215 aa  97.1  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3355  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.53 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.687232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002211  transcriptional regulator LuxR family  34.67 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.13 
 
 		 236 aa  97.1  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1635  LuxR family two component transcriptional regulator  34.3 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4082  two component LuxR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  34.93 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 237 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.7 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4024  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 216 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  34.13 
 
 		 219 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7667  two component LuxR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 215 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1237  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 216 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317123 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 221 aa  94.7  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 218 aa  94.7  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 303 aa  94.7  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.02 
 
 		 230 aa  94.7  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4349  two component LuxR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20794  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3305  LuxR family DNA-binding response regulator  31.34 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  35.71 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1543  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.72 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 238 aa  94  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.92 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0694  two component LuxR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 252 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.770061  normal  0.351457 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  32.38 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  31.86 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.21 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.43 
 
 		 234 aa  93.2  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  33 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  33.5 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2354  two component LuxR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 236 aa  93.2  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.7 
 
 		 224 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.42 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2326  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000518478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  30.69 
 
 		 217 aa  92.8  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 226 aa  92.8  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  29.5 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 242 aa  92.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.23 
 
 		 224 aa  92.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.91 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  31.86 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 219 aa  92.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  32.86 
 
 		 213 aa  92  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5911  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 219 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 242 aa  92.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>