More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3589 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3589  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  438  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  0.0443312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 240 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2497  two component LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000315398  normal  0.0281112 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5980  two component LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2455  response regulator VSRC transcription regulator protein  35.64 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2334  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.15 
 
 		 221 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.477601  normal  0.267999 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2723  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.15 
 
 		 221 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2742  LuxR response regulator receiver  32.85 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2880  two component LuxR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02155  putative regulator in two-component regulatory system ; LuxR family protein  29.35 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.85 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3954  two component LuxR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 229 aa  98.6  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.41 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0852  two component LuxR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  30.88 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4027  DNA-binding response regulator, LuxR family  30.88 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0331  LuxR family DNA-binding response regulator  29.85 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  31.37 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.61 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0465  two component transcriptional regulator  27.45 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0315  LuxR family DNA-binding response regulator  29.85 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  29.9 
 
 		 218 aa  92.4  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2794  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  30.2 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.17 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  30.88 
 
 		 209 aa  92  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03258  two-component system regulatory protein  27.94 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1635  LuxR family two component transcriptional regulator  29.76 
 
 		 216 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4028  two component LuxR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4082  two component LuxR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 216 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0694  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 252 aa  90.1  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.770061  normal  0.351457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0261  two component LuxR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 210 aa  89.7  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.574059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38490  Response regulator, LuxR family  29.56 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4024  two component LuxR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4737  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.64 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0133592 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0408  two component LuxR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  29.19 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0290  response regulator receiver protein  27.59 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.173401  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1981  two component LuxR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.607794  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1237  two component LuxR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317123 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.52 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1369  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.02 
 
 		 218 aa  88.6  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 215 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 215 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 215 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3091  two component LuxR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 212 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3131  two component LuxR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0264  two component LuxR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 221 aa  88.2  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2672  LuxR family DNA-binding response regulator  27.86 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00157  transcriptional regulator LuxR  26.64 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1450  two component LuxR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02404  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  28.43 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0866  two component LuxR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4197  two component LuxR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.25 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  29.56 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  30.77 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  30.77 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  30.77 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2570  two component LuxR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  31.28 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  30.77 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.05 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1549  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.5 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196807  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3283  two component LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.335218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46360  putative two-component response regulator  28.12 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.306063  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.65 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5839  two component LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.242407  hitchhiker  0.00194364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.59 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1151  two-component response regulator  27.35 
 
 		 248 aa  86.3  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  28.18 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0836  LuxR family two component transcriptional regulator  29.76 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0588074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0664  two component LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.358413 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1120  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.63 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.118956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0625  two component LuxR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793996  hitchhiker  0.00440064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4192  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.21 
 
 		 251 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.270399  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  29.95 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0522  response regulator receiver protein  29.76 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1543  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.94 
 
 		 221 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3356  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.83 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.334369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0341  two component LuxR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.73 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1028  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.17 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.146412  normal  0.260968 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2076  response regulator receiver protein  27.18 
 
 		 238 aa  85.5  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>