More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_46360 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_46360  putative two-component response regulator  100 
 
 		 210 aa  407  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3950  LuxR family DNA-binding response regulator  86.19 
 
 		 210 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3254  two component LuxR family transcriptional regulator  71 
 
 		 201 aa  271  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0897  DNA-binding response regulator, LuxR family  57.35 
 
 		 207 aa  231  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4349  two component LuxR family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 206 aa  195  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20794  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3606  two component LuxR family transcriptional regulator  55.9 
 
 		 208 aa  188  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4040  two component LuxR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2326  two component LuxR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000518478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2885  putative transcriptional regulator  48.98 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4204  two component LuxR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 202 aa  165  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00789571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33920  putative transcriptional regulator  48.47 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.100556  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1452  two component LuxR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890026 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5188  two component response regulator  43.15 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0164  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 215 aa  131  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1870  two component LuxR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 213 aa  124  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2245  two component LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00227369  normal  0.0543921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 222 aa  118  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02404  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  35.71 
 
 		 218 aa  117  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2406  transcriptional regulator NarP  40.2 
 
 		 210 aa  118  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1932  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 219 aa  117  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00601791  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2711  transcriptional regulator NarP  39.71 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281479  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2341  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.32 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.193906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4737  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.15 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0133592 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2472  transcriptional regulator NarP  38.83 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  38.83 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  38.83 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.58 
 
 		 224 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  38.83 
 
 		 215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167087 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  38.83 
 
 		 215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4590  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.35 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.590508  normal  0.147521 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6192  two component LuxR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  0.0472092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4220  response regulator receiver  35.35 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.89842 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.32 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1543  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.44 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  31.16 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03258  two-component system regulatory protein  33.5 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0264  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2570  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0852  two component LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.95 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3229  two component LuxR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0315  LuxR family DNA-binding response regulator  39 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0991  two component LuxR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3975  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.99 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0482097  normal  0.237128 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38930  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  34.93 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.93 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0465  two component transcriptional regulator  33.17 
 
 		 239 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.93 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02155  putative regulator in two-component regulatory system ; LuxR family protein  33.82 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.27 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0625  two component LuxR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793996  hitchhiker  0.00440064 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  31.82 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  35.1 
 
 		 217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1849  DNA-binding response regulator NarL  33.48 
 
 		 233 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4192  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.29 
 
 		 251 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.270399  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  39.63 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.51 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3356  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.12 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.334369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2275  LuxR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1943  two component LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0331  LuxR family DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  34.63 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1571  XRE family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0408  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 233 aa  107  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4028  two component LuxR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 212 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2941  two component LuxR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0613  nitrate/nitrite response regulator NarP  35.44 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1466  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.44 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.34 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2408  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0426941  normal  0.882432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  35.44 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  35.44 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2665  LuxR family two component transcriptional regulator  33.8 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  37.13 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  35.44 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  35.44 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  35.44 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  35.44 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  35.44 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  35.5 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  35.44 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3317  putative transcriptional regulator  35.27 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0866  two component LuxR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4001  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>