More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4001 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4001  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 236 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 223 aa  121  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 222 aa  118  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  38.61 
 
 		 227 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46360  putative two-component response regulator  36.36 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.01 
 
 		 241 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.07 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.04 
 
 		 216 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.25 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  36.36 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.61 
 
 		 215 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  31.84 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1651  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.06 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3950  LuxR family DNA-binding response regulator  35.79 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.17 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6962  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.42 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.37 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.08 
 
 		 226 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  33.17 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  33.17 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  33.17 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2711  transcriptional regulator NarP  33.66 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  33.17 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.9 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.9 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  29.61 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.98 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.66 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2406  transcriptional regulator NarP  33.66 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  31 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  32.35 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.85 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.1 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.68 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 217 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.63 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.48 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.21 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  37.31 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  34.93 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  34.93 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  33.17 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 211 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  34.93 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  34.93 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  34.45 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167087 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  34.45 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  34.93 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  34.93 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  34.93 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.47 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.82 
 
 		 222 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  34.45 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.71 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.37 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 210 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.73 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  30.84 
 
 		 242 aa  99  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  34.45 
 
 		 215 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2472  transcriptional regulator NarP  34.45 
 
 		 215 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1466  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.93 
 
 		 215 aa  99  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25338  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.81 
 
 		 212 aa  99  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2794  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  30.39 
 
 		 209 aa  99  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 209 aa  99  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2003  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.88 
 
 		 219 aa  99  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183245  hitchhiker  0.00373502 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 212 aa  98.6  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  35.18 
 
 		 213 aa  98.6  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  30.39 
 
 		 209 aa  98.6  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  35.89 
 
 		 207 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  32.49 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0365  two component LuxR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.210231  normal  0.243335 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.53 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  32.49 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>