More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3950 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3950  LuxR family DNA-binding response regulator  100 
 
 		 210 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46360  putative two-component response regulator  86.19 
 
 		 210 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3254  two component LuxR family transcriptional regulator  68.47 
 
 		 201 aa  270  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0897  DNA-binding response regulator, LuxR family  59.11 
 
 		 207 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4349  two component LuxR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20794  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4040  two component LuxR family transcriptional regulator  51.83 
 
 		 216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3606  two component LuxR family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 208 aa  181  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2326  two component LuxR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 210 aa  178  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000518478 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4204  two component LuxR family transcriptional regulator  48.22 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00789571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2885  putative transcriptional regulator  47.96 
 
 		 213 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33920  putative transcriptional regulator  48.47 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.100556  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1452  two component LuxR family transcriptional regulator  51.31 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890026 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5188  two component response regulator  40.5 
 
 		 220 aa  148  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1870  two component LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 218 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0164  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2245  two component LuxR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00227369  normal  0.0543921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1932  DNA-binding response regulator  34.16 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00601791  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2472  transcriptional regulator NarP  39.32 
 
 		 215 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  40.58 
 
 		 215 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167087 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  40.58 
 
 		 215 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  40.58 
 
 		 215 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  39.32 
 
 		 215 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02404  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  35.89 
 
 		 218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03258  two-component system regulatory protein  33.5 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2711  transcriptional regulator NarP  40.3 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281479  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2406  transcriptional regulator NarP  40.3 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0852  two component LuxR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3975  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0482097  normal  0.237128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0264  two component LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2275  LuxR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1543  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.13 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  35.02 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2341  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.193906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.93 
 
 		 218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.93 
 
 		 218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1466  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.42 
 
 		 215 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.59 
 
 		 236 aa  108  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0625  two component LuxR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793996  hitchhiker  0.00440064 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  38.42 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  38.42 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  38.42 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  35.41 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  38.42 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  38.42 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  38.42 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  29.65 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  38.42 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  38.42 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4192  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.5 
 
 		 251 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.270399  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0836  LuxR family two component transcriptional regulator  36.45 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0588074 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  38.73 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  31.31 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2570  two component LuxR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3314  putative two-component response regulator  37.25 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.18 
 
 		 212 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0866  two component LuxR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2941  two component LuxR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 251 aa  104  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1943  two component LuxR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 221 aa  104  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38930  putative transcriptional regulator  33.82 
 
 		 221 aa  104  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  33.18 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3229  two component LuxR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4565  two component LuxR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1888  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.75 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2408  two component LuxR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0426941  normal  0.882432 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0613  nitrate/nitrite response regulator NarP  35.44 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1571  XRE family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6192  two component LuxR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 231 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  0.0472092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1450  two component LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.67 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4737  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 		 241 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0133592 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 232 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.173401  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.06 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3356  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.7 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.334369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.306063  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0991  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  35.27 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02155  putative regulator in two-component regulatory system ; LuxR family protein  31.86 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  31.37 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3283  two component LuxR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.335218 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4854  putative two component LuxR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0929  two component LuxR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000567962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 212 aa  102  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>