More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6962 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6962  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 234 aa  448  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38740  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  53.3 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.99 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.17 
 
 		 216 aa  105  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  37.79 
 
 		 219 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0262  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0721339  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  36.45 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.92 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4001  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.07 
 
 		 236 aa  99.8  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0164  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.89 
 
 		 234 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0441129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.67 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.32 
 
 		 214 aa  99.4  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 223 aa  98.6  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.21 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  33.5 
 
 		 209 aa  98.2  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.7 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.55 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.05 
 
 		 218 aa  95.9  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  33.98 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 207 aa  95.5  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 230 aa  95.1  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 216 aa  95.5  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7160  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 224 aa  94.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 219 aa  94.7  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.45 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.6 
 
 		 219 aa  93.6  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1951  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.72 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.74 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  31 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.88 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.21 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.21 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.51 
 
 		 211 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.85 
 
 		 213 aa  92  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.6 
 
 		 215 aa  92  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 209 aa  92  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  31.25 
 
 		 209 aa  92  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3277  transcriptional regulator, LuxR family  28.64 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.53 
 
 		 228 aa  91.7  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.99 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.16 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 218 aa  91.7  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 208 aa  91.7  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  33.33 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2352  two component LuxR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.86 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.65 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.02 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  28.02 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5499  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 213 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00659712  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.73 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3748  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  90.1  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  37.56 
 
 		 220 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.33 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  30.62 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 209 aa  89.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  28.02 
 
 		 210 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3028  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.42 
 
 		 225 aa  89.4  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  decreased coverage  0.0000266978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  33.82 
 
 		 227 aa  88.6  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.11 
 
 		 215 aa  88.6  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  28.02 
 
 		 210 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  28.02 
 
 		 210 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  28.02 
 
 		 210 aa  88.6  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  28.02 
 
 		 210 aa  88.6  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.05 
 
 		 217 aa  88.6  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  28.02 
 
 		 210 aa  88.6  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  28.02 
 
 		 210 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 210 aa  88.6  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.38 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.72 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  28.02 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  30.88 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.74 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  30.81 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  30.81 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2190  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.81 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000643495  hitchhiker  0.000215707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.1 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.91 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.44 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  33.49 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>