More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38740 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38740  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  100 
 
 		 250 aa  500  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6962  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.3 
 
 		 234 aa  201  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0164  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.9 
 
 		 234 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0441129 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.27 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.13 
 
 		 226 aa  101  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  29.82 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  29.82 
 
 		 232 aa  99.4  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0851  DNA-binding response regulator  35.27 
 
 		 223 aa  99.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464733  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.94 
 
 		 209 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.22 
 
 		 224 aa  99  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.74 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  35.78 
 
 		 206 aa  98.2  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.05 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.63 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  30.18 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  35.11 
 
 		 220 aa  95.9  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 		 210 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  29.73 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  29.73 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1518.1  DNA-binding response regulator  35.11 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000399536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0560  DNA-binding response regulator  35.11 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0224831  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.74 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2085  DNA-binding response regulator  35.11 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.844485  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  32.16 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2151  DNA-binding response regulator  35.14 
 
 		 214 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.639034  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2062  LuxR family DNA-binding response regulator  35.14 
 
 		 214 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0947149  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0766  DNA-binding response regulator  35.14 
 
 		 214 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 219 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0262  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.07 
 
 		 225 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0721339  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2417  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.81 
 
 		 226 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  30.23 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2367  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.81 
 
 		 226 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.64 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 208 aa  92.4  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1731  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.84 
 
 		 224 aa  92.4  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.44 
 
 		 216 aa  92.4  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.62 
 
 		 228 aa  92  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 210 aa  92  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1053  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.13 
 
 		 236 aa  91.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.295708  normal  0.0294181 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.31 
 
 		 210 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 232 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.31 
 
 		 210 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 219 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  33.47 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  30.23 
 
 		 210 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  30.23 
 
 		 210 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  30.23 
 
 		 210 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  30.23 
 
 		 210 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  32.02 
 
 		 226 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  30.23 
 
 		 210 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.08 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  30.23 
 
 		 210 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 210 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.59 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.682063 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1927  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.59 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  30.23 
 
 		 210 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0661  two component LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000223942  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.09 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.08 
 
 		 211 aa  90.5  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.3 
 
 		 226 aa  89.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1162  two component LuxR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 225 aa  89.7  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0194  two component LuxR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 262 aa  89.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00139406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4096  two component LuxR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 237 aa  89.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.811447  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 225 aa  89.4  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 237 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.7 
 
 		 236 aa  89  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4896  response regulator receiver  32.26 
 
 		 215 aa  89  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.446448  normal  0.220667 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  29.77 
 
 		 210 aa  89  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  29.03 
 
 		 215 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  29.49 
 
 		 215 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  32.89 
 
 		 219 aa  88.6  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  29.03 
 
 		 215 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 		 230 aa  88.6  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1350  LuxR family DNA-binding response regulator  30.91 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00111586  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.03 
 
 		 214 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.51 
 
 		 219 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  29.91 
 
 		 213 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 216 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.64 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.97 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  29.2 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  27.06 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.57 
 
 		 230 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.62 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 212 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4001  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.75 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1132  DNA-binding response regulator, LuxR family  30.8 
 
 		 225 aa  87  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.893152  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.6 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.31 
 
 		 224 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>