More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5070 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 210 aa  417  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  87.62 
 
 		 210 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  87.62 
 
 		 210 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  73.81 
 
 		 217 aa  310  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4518  two component LuxR family transcriptional regulator  75.24 
 
 		 236 aa  295  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0164  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.91 
 
 		 234 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0441129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1053  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.67 
 
 		 236 aa  174  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.295708  normal  0.0294181 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  45.93 
 
 		 206 aa  174  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2367  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2417  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1418  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.24 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4096  two component LuxR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 237 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.811447  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2840  LuxR family two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  38.83 
 
 		 210 aa  158  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0661  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 239 aa  158  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000223942  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 237 aa  157  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0930  LuxR family two component transcriptional regulator  40.6 
 
 		 240 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.545376  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 253 aa  156  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  38.83 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  38.83 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  38.83 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  38.83 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  38.83 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  38.83 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4554  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.49 
 
 		 245 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376132  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  38.83 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  39.15 
 
 		 234 aa  155  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  38.83 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3851  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2846  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 209 aa  154  9e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0209  two component LuxR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 223 aa  153  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.04 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  38.1 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.94 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.36 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1558  two component LuxR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 240 aa  151  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 216 aa  151  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  38.79 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1927  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.91 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.91 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.682063 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  38.94 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  39.25 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.79 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  38.94 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  38.94 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  38.94 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  38.94 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  38.94 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.45 
 
 		 225 aa  148  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  38.79 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  38.79 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  38.79 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  38.79 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.68 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  38.79 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  37.62 
 
 		 211 aa  147  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.03 
 
 		 228 aa  147  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  36.67 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  36.67 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  38.32 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  36.32 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.32 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1104  two component LuxR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.88 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3676  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0625047  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.16 
 
 		 224 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.35 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  37.62 
 
 		 207 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.01 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  38.5 
 
 		 239 aa  144  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  38.32 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.57 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  38.07 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.43 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.87 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>