More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0897 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0897  DNA-binding response regulator, LuxR family  100 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3254  two component LuxR family transcriptional regulator  61.88 
 
 		 201 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3950  LuxR family DNA-binding response regulator  59.11 
 
 		 210 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46360  putative two-component response regulator  57.35 
 
 		 210 aa  231  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2326  two component LuxR family transcriptional regulator  53.69 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000518478 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3606  two component LuxR family transcriptional regulator  50.76 
 
 		 208 aa  191  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4349  two component LuxR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20794  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1452  two component LuxR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 210 aa  184  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4040  two component LuxR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2885  putative transcriptional regulator  44.67 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4204  two component LuxR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00789571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33920  putative transcriptional regulator  44.67 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.100556  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5188  two component response regulator  45.69 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1870  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0164  two component LuxR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.2 
 
 		 235 aa  124  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0852  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2275  LuxR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02155  putative regulator in two-component regulatory system ; LuxR family protein  37.26 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03258  two-component system regulatory protein  31.07 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002211  transcriptional regulator LuxR family  36.27 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1543  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00157  transcriptional regulator LuxR  36.04 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  35.35 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1932  DNA-binding response regulator  34.67 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00601791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.31 
 
 		 215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0836  LuxR family two component transcriptional regulator  35.64 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0588074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3283  two component LuxR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.335218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.306063  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4192  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 251 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.270399  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4565  two component LuxR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 224 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2824  transcriptional regulator, LuxR response regulator receiver  35.53 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4028  two component LuxR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0664  two component LuxR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.358413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2941  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0625  two component LuxR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793996  hitchhiker  0.00440064 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0613  nitrate/nitrite response regulator NarP  32.83 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02404  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  32.82 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0584  two component response regulator  34.31 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2554  two component LuxR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.958854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1545  two component LuxR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10861  nitrate/nitrite response transcriptional regulatory protein narL  34 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000061441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2245  two component LuxR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00227369  normal  0.0543921 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4854  putative two component LuxR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3975  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0482097  normal  0.237128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.68 
 
 		 215 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  32.51 
 
 		 217 aa  108  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1450  two component LuxR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4590  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.5 
 
 		 244 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.590508  normal  0.147521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4220  response regulator receiver  30.5 
 
 		 244 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.89842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.637953  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.05 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1858  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.62 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00870294  decreased coverage  0.00000000166193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2493  two component LuxR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  31.5 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0866  two component LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0522  response regulator receiver protein  31.1 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2076  response regulator receiver protein  29.35 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0920  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.32 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2606  two component LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00642184  hitchhiker  0.00275886 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0273  two component LuxR family transcriptional regulator  34 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  31.5 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.66 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3305  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3170  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  29.52 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2721  two component LuxR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 210 aa  105  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0264  two component LuxR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 221 aa  104  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3355  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 208 aa  104  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.687232  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  33 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0937  LuxR family DNA-binding response regulator  30.48 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.715087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.82 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4822  two component LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1981  two component LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.607794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 220 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0618082  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  29.21 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2370  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  33 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2341  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.18 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.193906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.47 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 238 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1867  two component LuxR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00198288  hitchhiker  0.000309651 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1732  two component LuxR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0049943  normal  0.183248 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1663  two component LuxR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0154836  unclonable  0.0000152825 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2247  two component LuxR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.998494  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0179  LuxR family DNA-binding response regulator  31.28 
 
 		 219 aa  101  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0261  two component LuxR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 210 aa  101  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.574059  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4737  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.5 
 
 		 241 aa  101  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0133592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>