More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4204 on replicon NC_009425
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009425  Ent638_4204  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  403  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00789571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3254  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0897  DNA-binding response regulator, LuxR family  45.77 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3950  LuxR family DNA-binding response regulator  48.22 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46360  putative two-component response regulator  46.53 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2326  two component LuxR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000518478 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3606  two component LuxR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4349  two component LuxR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 206 aa  148  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20794  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4040  two component LuxR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1452  two component LuxR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2885  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0164  two component LuxR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 215 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5188  two component response regulator  37.56 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0584  two component response regulator  36.54 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33920  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.100556  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0852  two component LuxR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 224 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.12 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1450  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2341  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.15 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.193906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1537  putative two-component response regulator  35.32 
 
 		 217 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17670  LuxR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 217 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38490  Response regulator, LuxR family  35.82 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  33.01 
 
 		 219 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  32.51 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2674  two component transcriptional regulator  35.32 
 
 		 228 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00219271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  34.34 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2275  LuxR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0408  two component LuxR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1159  two component LuxR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.942847  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0273  two component LuxR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 221 aa  104  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1237  two component LuxR family transcriptional regulator  34 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  35.1 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4024  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136895 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4184  hypothetical protein  34.34 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.400045  normal  0.380291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.45 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4027  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.84 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0264  two component LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1249  two component LuxR family transcriptional regulator  31 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0315  LuxR family DNA-binding response regulator  38.42 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0625  two component LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793996  hitchhiker  0.00440064 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2591  two component LuxR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211381  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1543  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.23 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1932  two component LuxR family transcriptional regulator  31 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.23 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.23 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1545  two component LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 219 aa  101  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0290  response regulator receiver protein  31.66 
 
 		 210 aa  101  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02155  putative regulator in two-component regulatory system ; LuxR family protein  33.17 
 
 		 211 aa  101  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0261  two component LuxR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.574059  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3782  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1635  LuxR family two component transcriptional regulator  34 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2794  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  33.17 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.88 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4801  two component LuxR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4822  two component LuxR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1981  two component LuxR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.607794  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3954  two component LuxR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  33.17 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4082  two component LuxR family transcriptional regulator  34 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  31.55 
 
 		 219 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0331  LuxR family DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03258  two-component system regulatory protein  32.51 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2665  LuxR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1870  two component LuxR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 218 aa  99  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0664  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  99  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.358413 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2648  LuxR family DNA-binding response regulator  32.84 
 
 		 220 aa  98.6  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0219  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.15 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.463895 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 194 aa  98.6  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0091  two component LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2711  transcriptional regulator NarP  33.83 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281479  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4897  response regulator receiver  30.35 
 
 		 214 aa  98.2  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275297  normal  0.216824 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1932  DNA-binding response regulator  33.82 
 
 		 219 aa  98.2  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00601791  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.23 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4192  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.56 
 
 		 251 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.270399  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2247  two component LuxR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 220 aa  97.8  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.998494  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0694  two component LuxR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 252 aa  97.8  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.770061  normal  0.351457 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2354  two component LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 236 aa  97.8  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0937  LuxR family DNA-binding response regulator  34.3 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.715087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2245  two component LuxR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00227369  normal  0.0543921 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  34.15 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4565  two component LuxR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0618082  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1663  two component LuxR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0154836  unclonable  0.0000152825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2076  response regulator receiver protein  30.88 
 
 		 238 aa  97.1  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2614  two component LuxR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2406  transcriptional regulator NarP  33.17 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  34.15 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0836  LuxR family two component transcriptional regulator  33.98 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0588074 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2061  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.27 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.737796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>