More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4801 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4801  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0596  two component LuxR family transcriptional regulator  55.66 
 
 		 228 aa  221  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1110  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.9 
 
 		 245 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  58.26 
 
 		 244 aa  218  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0202732  normal  0.168937 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5114  two component LuxR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 230 aa  211  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3782  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.75 
 
 		 223 aa  208  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3138  two component LuxR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892266 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1943  two component LuxR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2665  LuxR family two component transcriptional regulator  37.62 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2173  two component LuxR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 221 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2326  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000518478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4981  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3254  two component LuxR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0852  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3317  putative transcriptional regulator  36.95 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4024  two component LuxR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38930  putative transcriptional regulator  36.45 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3229  two component LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1870  two component LuxR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0991  two component LuxR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3975  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.55 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0482097  normal  0.237128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0341  two component LuxR family transcriptional regulator  37 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0694  two component LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.770061  normal  0.351457 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0264  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4344  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1635  LuxR family two component transcriptional regulator  38.19 
 
 		 216 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03258  two-component system regulatory protein  33.16 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4082  two component LuxR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 216 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1574  two component LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347453 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1571  XRE family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0836  LuxR family two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0588074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1543  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.02 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  35.35 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1237  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0920  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.92 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491034  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3606  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4565  two component LuxR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4822  two component LuxR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2941  two component LuxR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 251 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02260  Response regulator, LuxR family (CheY, HTH domains)  33.17 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4204  two component LuxR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00789571  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4027  DNA-binding response regulator, LuxR family  34.85 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0625  two component LuxR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793996  hitchhiker  0.00440064 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3716  two component LuxR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.576881  normal  0.099275 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  33.02 
 
 		 221 aa  106  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4192  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.41 
 
 		 251 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.270399  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0290  response regulator receiver protein  34.02 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1932  DNA-binding response regulator  30.35 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00601791  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3954  two component LuxR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7667  two component LuxR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0261  two component LuxR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 210 aa  104  8e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.574059  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0960  two component LuxR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 214 aa  104  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02404  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  34.54 
 
 		 218 aa  105  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02155  putative regulator in two-component regulatory system ; LuxR family protein  32.5 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3170  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  30.39 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1182  two component LuxR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192356 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38490  Response regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0664  two component LuxR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.358413 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2408  two component LuxR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0426941  normal  0.882432 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.306063  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3347  two component LuxR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.563314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2076  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 238 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1537  putative two-component response regulator  36.36 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4028  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3283  two component LuxR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.335218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17670  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0029  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.57 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2570  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  101  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0011  two component LuxR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0555  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.15 
 
 		 227 aa  101  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4737  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.1 
 
 		 241 aa  101  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0133592 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.95 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2275  LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.57 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1981  two component LuxR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.607794  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.637953  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0522  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2493  two component LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3005  two component LuxR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 217 aa  99.4  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00815247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.9 
 
 		 235 aa  99  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1858  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.35 
 
 		 220 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00870294  decreased coverage  0.00000000166193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1732  two component LuxR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 220 aa  99  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0049943  normal  0.183248 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  30.19 
 
 		 220 aa  98.6  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4349  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20794  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 226 aa  98.6  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2648  LuxR family DNA-binding response regulator  32.52 
 
 		 220 aa  98.6  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 220 aa  98.6  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0618082  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  34.16 
 
 		 215 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2721  two component LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 219 aa  98.2  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1813  two component LuxR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 249 aa  98.2  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.172477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2305  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  34.78 
 
 		 220 aa  98.6  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  34.16 
 
 		 215 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  34.16 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  34.16 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>