More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_33920 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_33920  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.100556  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2885  putative transcriptional regulator  98.59 
 
 		 213 aa  403  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4040  two component LuxR family transcriptional regulator  54.92 
 
 		 216 aa  191  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2326  two component LuxR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 210 aa  184  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000518478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0897  DNA-binding response regulator, LuxR family  45.77 
 
 		 207 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4349  two component LuxR family transcriptional regulator  51.31 
 
 		 206 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20794  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3950  LuxR family DNA-binding response regulator  49.25 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46360  putative two-component response regulator  49.25 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3606  two component LuxR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3254  two component LuxR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 201 aa  174  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1452  two component LuxR family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890026 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5188  two component response regulator  38.42 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4204  two component LuxR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 202 aa  132  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00789571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3229  two component LuxR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  35.91 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  35.91 
 
 		 219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.08 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.48 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.87 
 
 		 241 aa  111  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0937  LuxR family DNA-binding response regulator  34.98 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.715087  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  31.34 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.65 
 
 		 235 aa  108  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02404  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  37.86 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2275  LuxR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0852  two component LuxR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2341  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.193906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1543  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.12 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.91 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0584  two component response regulator  36.18 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4028  two component LuxR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0625  two component LuxR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793996  hitchhiker  0.00440064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.18 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  32.57 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02155  putative regulator in two-component regulatory system ; LuxR family protein  33.65 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 219 aa  104  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920509 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  33.33 
 
 		 217 aa  104  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.05 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.7 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.7 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.6 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.306063  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03258  two-component system regulatory protein  33.5 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3283  two component LuxR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 223 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.335218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1766  transcriptional regulator NarL  32.26 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2921  two component LuxR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190475 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0664  two component LuxR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.358413 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 227 aa  101  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.19 
 
 		 247 aa  101  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 228 aa  101  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  30.18 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0164  two component LuxR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0522  response regulator receiver protein  34.8 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.88 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.63 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  33.18 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2900  transcriptional regulator NarL  32.26 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3170  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  32.67 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0866  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 220 aa  99.4  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0694  two component LuxR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 252 aa  99.4  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.770061  normal  0.351457 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 254 aa  99  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 220 aa  99  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  37.26 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  34.45 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167087 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  34.45 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0596  two component LuxR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 228 aa  98.6  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.28 
 
 		 224 aa  98.6  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  34.45 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 223 aa  98.6  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  33.49 
 
 		 215 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2472  transcriptional regulator NarP  33.49 
 
 		 215 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  33.79 
 
 		 218 aa  98.2  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.01 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  97.8  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.52 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3982  DNA-binding nitrate/nitrite response regulator  34.8 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0655  two component LuxR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2570  two component LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0424  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.95 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.61 
 
 		 192 aa  97.8  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4822  two component LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002211  transcriptional regulator LuxR family  34.17 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>