More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1452 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1452  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  407  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0897  DNA-binding response regulator, LuxR family  52.48 
 
 		 207 aa  205  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4349  two component LuxR family transcriptional regulator  56.84 
 
 		 206 aa  201  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20794  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3254  two component LuxR family transcriptional regulator  55.28 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4040  two component LuxR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 216 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2326  two component LuxR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 210 aa  193  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000518478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46360  putative two-component response regulator  53.66 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3606  two component LuxR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 208 aa  185  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3950  LuxR family DNA-binding response regulator  51.47 
 
 		 210 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331441  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2885  putative transcriptional regulator  50.24 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5188  two component response regulator  48.28 
 
 		 220 aa  171  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33920  putative transcriptional regulator  50.24 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.100556  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4204  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  149  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00789571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.89 
 
 		 235 aa  121  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 215 aa  111  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02404  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  36.87 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3975  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0482097  normal  0.237128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4192  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.12 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.270399  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.09 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0852  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 224 aa  104  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3835  two component LuxR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 217 aa  104  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2941  two component LuxR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3229  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2408  two component LuxR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0426941  normal  0.882432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  31.92 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0584  two component response regulator  35.32 
 
 		 215 aa  101  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 250 aa  101  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  36.54 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0465  two component transcriptional regulator  30.85 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 254 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  34.31 
 
 		 219 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03258  two-component system regulatory protein  32.09 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1943  two component LuxR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 221 aa  99  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2232  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1450  two component LuxR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 224 aa  99  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1571  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 216 aa  99  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.54 
 
 		 352 aa  98.6  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0445779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  34.31 
 
 		 219 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4801  two component LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 223 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0625  two component LuxR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793996  hitchhiker  0.00440064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1543  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.96 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1981  two component LuxR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.607794  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.9 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.11 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0179  LuxR family DNA-binding response regulator  32.34 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.18 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4822  two component LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.41 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2689  two component LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  31.53 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3317  putative transcriptional regulator  33.17 
 
 		 221 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4590  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.98 
 
 		 244 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.590508  normal  0.147521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4220  response regulator receiver  31.98 
 
 		 244 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.89842 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0866  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.49 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2173  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1766  transcriptional regulator NarL  31.25 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0836  LuxR family two component transcriptional regulator  36.14 
 
 		 224 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0588074 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0219  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.65 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.463895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3138  two component LuxR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2665  LuxR family two component transcriptional regulator  31.31 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2570  two component LuxR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4565  two component LuxR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3170  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  31.98 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38930  putative transcriptional regulator  32.21 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 232 aa  92.4  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.52 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.52 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1813  two component LuxR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 249 aa  92.4  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.172477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1870  two component LuxR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4028  two component LuxR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02155  putative regulator in two-component regulatory system ; LuxR family protein  32.32 
 
 		 211 aa  91.7  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  31.19 
 
 		 209 aa  91.3  9e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 254 aa  91.3  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0164  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1932  DNA-binding response regulator  31.31 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00601791  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.306063  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.07 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2245  two component LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00227369  normal  0.0543921 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4737  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.76 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0133592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0273  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.53 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.25 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.682063 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1927  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.25 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3355  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.99 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.687232  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0694  two component LuxR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.770061  normal  0.351457 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1574  two component LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 218 aa  89.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>