More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3835 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3835  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  423  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  55.4 
 
 		 227 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  56.19 
 
 		 213 aa  221  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.93 
 
 		 220 aa  215  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3409  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.42 
 
 		 221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306896  hitchhiker  0.000114505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1435  two component LuxR family transcriptional regulator  54.98 
 
 		 218 aa  211  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.3 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1446  response regulator receiver protein  50.96 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167897  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3326  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.88 
 
 		 223 aa  175  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  40 
 
 		 221 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  43 
 
 		 210 aa  168  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.83 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.54 
 
 		 211 aa  164  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  47.87 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  41.51 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1874  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.14 
 
 		 213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  45.97 
 
 		 207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.5 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  45.12 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0335  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.51 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  42.52 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 232 aa  158  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.76 
 
 		 218 aa  157  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 236 aa  157  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 222 aa  157  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.41 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  42.79 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.49 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.34 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 222 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 214 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2449  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  40.76 
 
 		 234 aa  155  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.32 
 
 		 224 aa  155  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  43.06 
 
 		 218 aa  155  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 237 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  41.98 
 
 		 217 aa  154  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.47 
 
 		 226 aa  154  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.34 
 
 		 228 aa  154  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  43 
 
 		 209 aa  154  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4158  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.14 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.73 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  42.45 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.96 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  42.45 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  42.45 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  42.45 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  42.45 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.7 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  42.45 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.92 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  42.52 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.93 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.93 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.72 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  41.98 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 218 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 303 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  44.65 
 
 		 230 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  41.98 
 
 		 215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.12 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.74 
 
 		 222 aa  151  7e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.19 
 
 		 239 aa  151  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  39.91 
 
 		 235 aa  151  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  42.45 
 
 		 215 aa  151  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 229 aa  151  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3696  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.76 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.12 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  38.83 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45.75 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>