More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2814 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2814  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  440  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002362  DNA-binding HTH domain-containing protein  52.8 
 
 		 214 aa  233  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0501055  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03706  hypothetical protein  52.34 
 
 		 214 aa  227  8e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06533  hypothetical protein  38.01 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05153  hypothetical protein  43.06 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001276  transcriptional regulator VpsT  44.44 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2858  probable CsgAB operon transcriptional regulatory protein  32.84 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.256874  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  36.51 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  41.67 
 
 		 222 aa  111  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0287  LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 224 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1053  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3306  LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  33.85 
 
 		 232 aa  101  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01037  DNA-binding transcriptional activator in two-component regulatory system  37.42 
 
 		 216 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01044  hypothetical protein  37.42 
 
 		 216 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1253  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  37.42 
 
 		 216 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.705931 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2231  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  37.42 
 
 		 216 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.750523  normal  0.99411 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1238  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  37.42 
 
 		 216 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2048  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  37.42 
 
 		 216 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0804096  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1208  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  37.42 
 
 		 216 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316434  normal  0.419874 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2093  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  37.42 
 
 		 190 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1419  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  37.42 
 
 		 216 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132272 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1159  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  37.42 
 
 		 216 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1556  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  36.2 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417219  normal  0.369793 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2605  transcriptional regulator, LuxR family  36.81 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.196673  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1158  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  36.81 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.354651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2559  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  36.81 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.980478  normal  0.382247 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  38.58 
 
 		 221 aa  91.3  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1880  LuxR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3333  response regulator receiver protein  34.56 
 
 		 196 aa  85.5  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1517  transcriptional regulator, LuxR family protein  31.58 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.776537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03493  hypothetical protein  39.69 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2327  regulatory protein, LuxR  31.34 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2905  transcriptional regulator, LuxR family  34.51 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1446  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0398792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2332  response regulator receiver protein  29.48 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5522  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1788  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1817  LuxR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.596206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2490  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1832  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1796  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1619  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 163 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113726  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 163 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1592  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 162 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2725  LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3945  LuxR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00801334  normal  0.811932 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2316  LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2386  LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2509  LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592216  hitchhiker  0.00000482381 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1726  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.474249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1410  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.62 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.46664  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3194  LuxR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0232917  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3302  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 221 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2759  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550861  normal  0.145492 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0633  LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2948  response regulator receiver protein  27.46 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0560  transcriptional regulator, LuxR family protein  31.62 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.77 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.36 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3887  LuxR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000207134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2620  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.649971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.14 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01507  putative transcriptional regulator, LuxR family protein  32.48 
 
 		 159 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.993499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1011  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.44 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0720  LuxR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0333677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3414  LuxR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.295313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4433  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.05 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0644  LuxR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140532  unclonable  0.00000001613 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3500  response regulator receiver protein  30.99 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3137  response regulator receiver protein  30.07 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0875  LuxR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0863  transcriptional regulator, LuxR family  29.37 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4147  two component LuxR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0840  response regulator receiver protein  30.28 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0864  LuxR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3096  regulatory protein, LuxR  32.61 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.735562  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  34.82 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.58 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  35 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6427  two component LuxR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  34.38 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.05 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2881  response regulator receiver  42.86 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00126066  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.82 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.46 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.04 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1611  two component LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  0.234442 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  38.04 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.4 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 227 aa  62  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4028  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2045  LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 547 aa  62  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1473  transcriptional regulator, LuxR family  36.89 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.55 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>