More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0707 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0707  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 270 aa  525  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0156  two component transcriptional regulator, LuxR family  68.18 
 
 		 230 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.4 
 
 		 242 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.527048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 228 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  38.39 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 213 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.47 
 
 		 218 aa  115  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.89 
 
 		 220 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.41 
 
 		 224 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25620  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.57 
 
 		 219 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  35.41 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.41 
 
 		 222 aa  112  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 223 aa  112  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.24 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  37.21 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4511  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.45 
 
 		 214 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.29 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4684  two component LuxR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 223 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6405  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.07 
 
 		 225 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2689  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.44 
 
 		 223 aa  108  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal  0.346923 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.09 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2010  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.61 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  33.01 
 
 		 232 aa  107  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 225 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.6 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 219 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.1 
 
 		 221 aa  106  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 232 aa  105  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.42 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.95 
 
 		 232 aa  105  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  31.88 
 
 		 232 aa  105  9e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 224 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  31.43 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  33.49 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.15 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6284  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.76 
 
 		 217 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  30.05 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.91 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1125  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.16 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.05 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00793239  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.17 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.56 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7160  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.42 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  34.3 
 
 		 214 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.39 
 
 		 230 aa  103  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  32.38 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0253  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.43 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  35.21 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3748  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.93 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 217 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 228 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  30.95 
 
 		 210 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.11 
 
 		 242 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  30.95 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  30.95 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  30.95 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.85 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  30.95 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  30.95 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  34.12 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0209  two component LuxR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  30.95 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0239  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.09 
 
 		 230 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  33.33 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  34.48 
 
 		 221 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4508  response regulator receiver protein  33.97 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401356  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  30.95 
 
 		 210 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.97 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.97 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.1 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 210 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 211 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 226 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.7 
 
 		 228 aa  99.8  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.02 
 
 		 239 aa  99.8  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.13 
 
 		 217 aa  99.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 218 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 205 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1951  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.97 
 
 		 226 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4857  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 234 aa  99.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.243741 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3475  response regulator receiver  37.9 
 
 		 228 aa  99.4  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.15 
 
 		 221 aa  99.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  34.74 
 
 		 227 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.89 
 
 		 217 aa  99.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>