More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6284 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6284  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 217 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2136  two component LuxR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 240 aa  188  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.92 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.18 
 
 		 226 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.72 
 
 		 221 aa  164  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.33 
 
 		 215 aa  164  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 226 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.01 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  41.47 
 
 		 220 aa  161  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6405  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.1 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  40.55 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.28 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  41.26 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.55 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.12 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.4 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.09 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  42.33 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 220 aa  155  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.2 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4511  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.28 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.74 
 
 		 225 aa  154  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.93 
 
 		 219 aa  154  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  39.55 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  40.55 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.55 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3727  two component LuxR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.63 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  41.1 
 
 		 230 aa  151  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.33 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0608  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.82 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  39.27 
 
 		 218 aa  151  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 219 aa  151  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  37.61 
 
 		 261 aa  150  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.47 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3390  two component LuxR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.13 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.91 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.09 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 219 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 224 aa  147  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.37 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3748  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.96 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0647  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.07 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.518884  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.07 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.07 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1951  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4684  two component LuxR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 223 aa  145  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3287  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.11 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0842926  normal  0.330639 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04500  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.01 
 
 		 244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.11 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.37 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.25 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4872  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 232 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39200  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.17 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.36 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  38.43 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  37.33 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7160  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.61 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.47 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.51 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5499  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00659712  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.55 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  36.87 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  36.41 
 
 		 239 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3669  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  39.63 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.9 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.37 
 
 		 226 aa  141  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4508  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 219 aa  141  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401356  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.45 
 
 		 234 aa  141  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  39.91 
 
 		 212 aa  141  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 223 aa  141  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.86 
 
 		 234 aa  141  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.27 
 
 		 226 aa  141  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.25 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.14 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>