More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0156 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0156  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 230 aa  443  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0707  two component transcriptional regulator, LuxR family  69.16 
 
 		 270 aa  269  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.527048  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.9 
 
 		 214 aa  118  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25620  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.37 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.02 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4511  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.1 
 
 		 226 aa  105  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.33 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7160  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6405  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.81 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4684  two component LuxR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 216 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  31.75 
 
 		 212 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.79 
 
 		 217 aa  101  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.01 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  36.96 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3390  two component LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.11 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.96 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.96 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.03 
 
 		 233 aa  99.8  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.53 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.96 
 
 		 239 aa  98.2  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.1 
 
 		 214 aa  98.2  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.89 
 
 		 215 aa  98.2  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  32.76 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1731  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  28.57 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.13 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.35 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  34.95 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2689  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal  0.346923 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.03 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2010  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.58 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.63 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  33.18 
 
 		 227 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  34.11 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.74 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39200  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.02 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6284  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 217 aa  95.9  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.76 
 
 		 230 aa  95.1  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0253  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.07 
 
 		 218 aa  95.5  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.76 
 
 		 215 aa  95.1  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3748  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.85 
 
 		 236 aa  94.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.11 
 
 		 214 aa  94.7  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 222 aa  94.7  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  31.28 
 
 		 220 aa  95.1  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.36 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1125  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.48 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.24 
 
 		 220 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1951  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.37 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.02 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.92 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3727  two component LuxR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.36 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8800  response regulator receiver protein  33.17 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.65 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.01 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.19 
 
 		 220 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.87 
 
 		 226 aa  94.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  33.96 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  31.28 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4508  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401356  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.27 
 
 		 225 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0239  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  32.55 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  32.55 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  32.56 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 244 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4260  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.14 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2658  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.6 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.74 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.07 
 
 		 234 aa  92  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.65 
 
 		 215 aa  92  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 218 aa  92  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  33.17 
 
 		 217 aa  92  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  34.6 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4672  response regulator receiver protein  31.07 
 
 		 212 aa  91.7  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223352  normal  0.339353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>