More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04820 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_04820  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  100 
 
 		 229 aa  450  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  88.32 
 
 		 216 aa  370  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  76.96 
 
 		 219 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  73.61 
 
 		 217 aa  306  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  74.06 
 
 		 228 aa  295  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  74.06 
 
 		 228 aa  295  5e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6044  two component transcriptional regulator, LuxR family  70.54 
 
 		 226 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  69.03 
 
 		 233 aa  286  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  73.15 
 
 		 212 aa  286  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  71.5 
 
 		 212 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5233  two component transcriptional regulator, LuxR family  70.28 
 
 		 223 aa  277  9e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114456  hitchhiker  0.000738291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  70.89 
 
 		 210 aa  276  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0915  two component transcriptional regulator, LuxR family  69.27 
 
 		 223 aa  273  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1737  regulatory protein LuxR  69.63 
 
 		 231 aa  268  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117285  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.82 
 
 		 218 aa  265  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  65.8 
 
 		 229 aa  260  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3033  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.6 
 
 		 232 aa  253  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  hitchhiker  0.000783277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1651  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.21 
 
 		 227 aa  251  6e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.705317  normal  0.304873 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.13 
 
 		 226 aa  249  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2998  two component LuxR family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5726  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.27 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0710  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.01 
 
 		 226 aa  246  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.614335  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2543  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.56 
 
 		 217 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.473476  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0656  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.09 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.214241 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28320  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  63.89 
 
 		 220 aa  240  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1769  putative response regulator  57.08 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0277  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.28 
 
 		 228 aa  230  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.0298075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5557  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.09 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17340  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  58.85 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.58 
 
 		 213 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4304  response regulator receiver  43.84 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.894661  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.66 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 221 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.65 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  38.46 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.31 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.71 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 219 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3326  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.75 
 
 		 223 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.48 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.37 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.46 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.93 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.55 
 
 		 211 aa  142  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.61 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  36.62 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.31 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0424  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  41.59 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0433  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.99 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.46 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 223 aa  138  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  40.49 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.75 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.85 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  43 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.85 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  39.91 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 216 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  40.89 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 220 aa  134  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.67 
 
 		 230 aa  135  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5911  two component LuxR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  42.52 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.86 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 303 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  39.71 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.15 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  38.71 
 
 		 215 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  38.71 
 
 		 215 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  38.71 
 
 		 215 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  38.71 
 
 		 215 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  38.71 
 
 		 215 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  39.34 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0335  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 211 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.48 
 
 		 1648 aa  132  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 218 aa  132  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.89 
 
 		 241 aa  132  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  37.16 
 
 		 222 aa  131  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 217 aa  131  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  39.25 
 
 		 216 aa  131  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 231 aa  131  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  37.79 
 
 		 215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>