More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1927 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1927  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 535 aa  1024    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  58.02 
 
 		 541 aa  525  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  54.49 
 
 		 554 aa  500  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 544 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 544 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 544 aa  395  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2885  LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 545 aa  352  8.999999999999999e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.488052  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2591  transcriptional regulator, LuxR family  45.68 
 
 		 552 aa  350  3e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000770971 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  40.94 
 
 		 562 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3766  response regulator receiver protein  36.53 
 
 		 539 aa  216  8e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484632  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2045  LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 547 aa  212  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3379  LuxR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 542 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3441  response regulator receiver protein  35.81 
 
 		 542 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0174834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3390  response regulator receiver protein  35.81 
 
 		 542 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1794  transcriptional regulator, LuxR family  38.96 
 
 		 537 aa  211  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000182459 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3284  transcriptional regulator, CadC  32.33 
 
 		 584 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58115 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4920  LuxR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 545 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  38.62 
 
 		 973 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  36.36 
 
 		 923 aa  75.5  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  50.47 
 
 		 954 aa  75.1  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  30.47 
 
 		 574 aa  74.3  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 973 aa  74.3  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  37 
 
 		 919 aa  73.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  44.92 
 
 		 928 aa  70.5  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  42.45 
 
 		 916 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  53.42 
 
 		 220 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.56 
 
 		 217 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  57.38 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  53.66 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.28 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  56.45 
 
 		 959 aa  67  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 225 aa  67  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  55.56 
 
 		 228 aa  66.6  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  52.46 
 
 		 209 aa  66.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.17 
 
 		 221 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 219 aa  65.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 982 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.38 
 
 		 236 aa  65.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  56.25 
 
 		 226 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 207 aa  65.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  47.62 
 
 		 207 aa  65.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 1000 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  42.86 
 
 		 963 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.74 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  41.94 
 
 		 1006 aa  65.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  61.82 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.58 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 913 aa  64.7  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  35.44 
 
 		 929 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2811  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.58 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  48.05 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  55.74 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5522  two component LuxR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.86 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0483  LuxR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 87 aa  63.9  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299787 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3519  response regulator receiver protein  53.12 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  38.85 
 
 		 910 aa  63.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.33 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  41.01 
 
 		 993 aa  63.5  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.46 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1652  two component LuxR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 217 aa  63.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  49.35 
 
 		 234 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.33 
 
 		 216 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  60 
 
 		 216 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  50 
 
 		 209 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  55.56 
 
 		 992 aa  63.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 956 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  38.79 
 
 		 938 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3915  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.7 
 
 		 226 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.0598624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 881 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  60 
 
 		 231 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 215 aa  63.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 881 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.33 
 
 		 216 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  53.12 
 
 		 227 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 876 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3028  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.33 
 
 		 225 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  decreased coverage  0.0000266978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  36.09 
 
 		 963 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  49.37 
 
 		 206 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  40.51 
 
 		 940 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  43.1 
 
 		 913 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  53.12 
 
 		 218 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  54.1 
 
 		 239 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 220 aa  62.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2031  LuxR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 91 aa  62.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 218 aa  62.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 221 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  50.82 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  38.97 
 
 		 567 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.52 
 
 		 223 aa  62  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>