More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3766 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3379  LuxR family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 542 aa  640    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3441  response regulator receiver protein  63.04 
 
 		 542 aa  640    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0174834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3766  response regulator receiver protein  100 
 
 		 539 aa  1073    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484632  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3390  response regulator receiver protein  63.04 
 
 		 542 aa  640    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2045  LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 547 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1794  transcriptional regulator, LuxR family  43.18 
 
 		 537 aa  349  7e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000182459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 562 aa  279  8e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 554 aa  244  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 541 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1927  transcriptional regulator, LuxR family  35.62 
 
 		 535 aa  204  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 544 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 544 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 544 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2591  transcriptional regulator, LuxR family  30.76 
 
 		 552 aa  167  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000770971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2885  LuxR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 545 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.488052  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3284  transcriptional regulator, CadC  28.1 
 
 		 584 aa  77.8  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58115 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  26.05 
 
 		 574 aa  74.3  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  33.47 
 
 		 768 aa  73.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  26.52 
 
 		 567 aa  73.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 982 aa  72.4  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0703  two component LuxR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 220 aa  72  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.901141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  51.52 
 
 		 525 aa  70.5  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.03 
 
 		 211 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  52.17 
 
 		 993 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.88 
 
 		 208 aa  69.3  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 216 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  38.17 
 
 		 970 aa  68.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  46.27 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  50 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  46.88 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  31.64 
 
 		 824 aa  67.8  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3404  transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 427 aa  67  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226025  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 207 aa  67  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 212 aa  66.6  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2058  metal dependent phosphohydrolase  43.28 
 
 		 521 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  49.28 
 
 		 967 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 526 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 221 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  45.95 
 
 		 526 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  45.95 
 
 		 526 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4872  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.23 
 
 		 232 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 954 aa  65.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 211 aa  65.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4288  metal dependent phosphohydrolase  44.62 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.472516  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2842  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  48.48 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  32.95 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  49.35 
 
 		 1084 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  40.86 
 
 		 516 aa  64.3  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1734  two component LuxR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159279  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4433  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.44 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.71 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  47.46 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  47.46 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  45.76 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  45.76 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 220 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 232 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  55.36 
 
 		 222 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  58.62 
 
 		 909 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 226 aa  63.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 227 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 227 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.97 
 
 		 209 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  43.55 
 
 		 222 aa  63.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 213 aa  63.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 209 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 209 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  39.68 
 
 		 207 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 207 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  33.16 
 
 		 910 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 799 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 213 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  46.55 
 
 		 222 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 229 aa  62.4  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.53 
 
 		 222 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  39.02 
 
 		 1006 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.38 
 
 		 235 aa  62.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  27.23 
 
 		 919 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 213 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  50.91 
 
 		 119 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 471 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 454 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>