More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2457 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 554 aa  1109    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  60.41 
 
 		 541 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1927  transcriptional regulator, LuxR family  54.49 
 
 		 535 aa  479  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 544 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 544 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 544 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2591  transcriptional regulator, LuxR family  43.05 
 
 		 552 aa  346  7e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000770971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2885  LuxR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 545 aa  335  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.488052  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  37.89 
 
 		 562 aa  302  9e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3766  response regulator receiver protein  35.74 
 
 		 539 aa  243  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484632  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1794  transcriptional regulator, LuxR family  37.22 
 
 		 537 aa  233  8.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000182459 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2045  LuxR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 547 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3379  LuxR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 542 aa  230  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3441  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 542 aa  230  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0174834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3390  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 542 aa  230  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3284  transcriptional regulator, CadC  32.64 
 
 		 584 aa  136  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58115 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4920  LuxR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 545 aa  89.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  30.8 
 
 		 574 aa  87  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  44.88 
 
 		 982 aa  85.9  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 876 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 881 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 881 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 216 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 216 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.74 
 
 		 213 aa  73.2  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  28.43 
 
 		 567 aa  73.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  40.77 
 
 		 970 aa  72.8  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 218 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  54.41 
 
 		 207 aa  72  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  52 
 
 		 210 aa  72  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.02 
 
 		 208 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 207 aa  72  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.47 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  41.55 
 
 		 916 aa  70.5  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 973 aa  70.1  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  52.94 
 
 		 206 aa  70.1  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.67 
 
 		 213 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 210 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 250 aa  70.1  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  53.33 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  40.65 
 
 		 1006 aa  69.3  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  42.5 
 
 		 993 aa  68.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  52.46 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  59.68 
 
 		 959 aa  67.8  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.91 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  53.33 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  53.33 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  53.33 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  53.33 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  53.33 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  53.33 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  53.33 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  53.33 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 967 aa  67  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  51.47 
 
 		 207 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  50.62 
 
 		 954 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  36.3 
 
 		 894 aa  66.6  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  30.53 
 
 		 973 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 246 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 189 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 225 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  55 
 
 		 216 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  45.33 
 
 		 234 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.04 
 
 		 210 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.1 
 
 		 211 aa  65.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 454 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  55 
 
 		 225 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  49.25 
 
 		 1022 aa  65.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  52.73 
 
 		 119 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.04 
 
 		 210 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2324  DNA-binding response regulator  51.61 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 222 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  48.48 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  51.39 
 
 		 864 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  39.47 
 
 		 967 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  49.25 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  52.54 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  52.54 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3999  transcriptional regulator, LuxR family  42.67 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4096  two component LuxR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.811447  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.46 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  50.82 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  32.18 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1473  transcriptional regulator, LuxR family  49.25 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  30.1 
 
 		 893 aa  64.3  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  49.18 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>