More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1794 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1794  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 537 aa  1039    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000182459 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2045  LuxR family transcriptional regulator  63.14 
 
 		 547 aa  549  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3379  LuxR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 542 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3441  response regulator receiver protein  44.09 
 
 		 542 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0174834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3766  response regulator receiver protein  43.18 
 
 		 539 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484632  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3390  response regulator receiver protein  44.09 
 
 		 542 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 562 aa  297  4e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 554 aa  252  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 541 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1927  transcriptional regulator, LuxR family  39.04 
 
 		 535 aa  216  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 544 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 544 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 544 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2591  transcriptional regulator, LuxR family  33.58 
 
 		 552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000770971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2885  LuxR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 545 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.488052  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3284  transcriptional regulator, CadC  31.06 
 
 		 584 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  31.91 
 
 		 893 aa  76.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.76 
 
 		 216 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 881 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 881 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 876 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.72 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  57.81 
 
 		 526 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  57.81 
 
 		 526 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  57.81 
 
 		 526 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.02 
 
 		 213 aa  72.4  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  45.59 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2058  metal dependent phosphohydrolase  55.56 
 
 		 521 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  45.35 
 
 		 516 aa  70.1  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 216 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  43.94 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  58.93 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.78 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4288  metal dependent phosphohydrolase  55.74 
 
 		 519 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.472516  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  37.98 
 
 		 567 aa  66.6  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  55 
 
 		 916 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 226 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 221 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3306  LuxR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 238 aa  65.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  47.54 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  50 
 
 		 207 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7606  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 214 aa  65.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  47.54 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  41.59 
 
 		 768 aa  64.7  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3826  transcriptional regulator, LuxR family  55.93 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.95 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 818 aa  63.9  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2605  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 216 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.196673  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2093  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  50 
 
 		 190 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1419  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  50 
 
 		 216 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132272 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  39.44 
 
 		 210 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  39.44 
 
 		 210 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  39.36 
 
 		 209 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 215 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  39.44 
 
 		 210 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  39.36 
 
 		 209 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  48.28 
 
 		 215 aa  63.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  39.36 
 
 		 209 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  48.28 
 
 		 215 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  44.07 
 
 		 91 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 959 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 215 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2048  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  50 
 
 		 216 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0804096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  39.44 
 
 		 210 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  39.36 
 
 		 209 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 215 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1208  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  50 
 
 		 216 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316434  normal  0.419874 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2231  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  50 
 
 		 216 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.750523  normal  0.99411 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  39.44 
 
 		 210 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 210 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05153  hypothetical protein  50 
 
 		 218 aa  63.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1158  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  50 
 
 		 216 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.354651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.36 
 
 		 209 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4530  two component LuxR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 241 aa  63.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1238  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  50 
 
 		 216 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1253  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  50 
 
 		 216 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.705931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.27 
 
 		 216 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  44.62 
 
 		 209 aa  63.2  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  39.44 
 
 		 210 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  43.56 
 
 		 574 aa  63.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001276  transcriptional regulator VpsT  48.28 
 
 		 210 aa  62.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 216 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  39.44 
 
 		 210 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 339 aa  63.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1159  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  50 
 
 		 216 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2559  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  50 
 
 		 216 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.980478  normal  0.382247 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  39.44 
 
 		 210 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>