More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2885 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2885  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 545 aa  1086    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.488052  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2591  transcriptional regulator, LuxR family  61.54 
 
 		 552 aa  595  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000770971 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 541 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  45.4 
 
 		 544 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  45.4 
 
 		 544 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  45.4 
 
 		 544 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 554 aa  369  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1927  transcriptional regulator, LuxR family  46.62 
 
 		 535 aa  362  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  36.18 
 
 		 562 aa  252  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2045  LuxR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 547 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3379  LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 542 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3441  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 542 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0174834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3390  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 542 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1794  transcriptional regulator, LuxR family  33.58 
 
 		 537 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000182459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3766  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 539 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484632  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3284  transcriptional regulator, CadC  31.22 
 
 		 584 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58115 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4920  LuxR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 545 aa  99.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  32.48 
 
 		 893 aa  85.1  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  28.42 
 
 		 574 aa  82  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  28.93 
 
 		 567 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  34.67 
 
 		 919 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  37.66 
 
 		 970 aa  75.5  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1989  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.02 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.33 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.84 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  40.15 
 
 		 1006 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0637  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.07 
 
 		 229 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 781 aa  72.4  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 218 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  56.67 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.38 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  40.94 
 
 		 982 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 973 aa  70.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  54.84 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.74 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  31.92 
 
 		 959 aa  70.1  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  34.08 
 
 		 919 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 881 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.1 
 
 		 213 aa  70.1  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 881 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.73 
 
 		 219 aa  69.3  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.67 
 
 		 221 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  56.67 
 
 		 206 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 208 aa  68.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 876 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  53.62 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 894 aa  68.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5522  two component LuxR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.96 
 
 		 220 aa  68.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.45 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.84 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1619  two component LuxR family transcriptional regulator  55 
 
 		 163 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113726  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  55 
 
 		 163 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1592  two component LuxR family transcriptional regulator  55 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  55.74 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  55 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3804  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.12 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.185264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  42.98 
 
 		 916 aa  67.4  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  55 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  53.23 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  56.67 
 
 		 227 aa  67  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 219 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.62 
 
 		 225 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  52.24 
 
 		 209 aa  66.6  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  50.82 
 
 		 209 aa  66.6  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.38 
 
 		 225 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4115  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 216 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071707  normal  0.0608108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.16 
 
 		 211 aa  66.6  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  56.67 
 
 		 230 aa  66.6  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  34.2 
 
 		 973 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.73 
 
 		 253 aa  66.6  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  50 
 
 		 224 aa  66.2  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 210 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  43.66 
 
 		 220 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.38 
 
 		 221 aa  66.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 218 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  44.32 
 
 		 215 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.61 
 
 		 225 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.65 
 
 		 225 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 526 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.05 
 
 		 239 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3475  response regulator receiver  58.33 
 
 		 228 aa  65.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  50.82 
 
 		 210 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  53.12 
 
 		 526 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  30.53 
 
 		 977 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>