More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4920 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4920  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 545 aa  1043    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  38.74 
 
 		 574 aa  242  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  38.56 
 
 		 567 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  31.27 
 
 		 562 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 544 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 544 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 544 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 554 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  33.68 
 
 		 541 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2885  LuxR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 545 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.488052  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1927  transcriptional regulator, LuxR family  33.69 
 
 		 535 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3379  LuxR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 542 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3441  response regulator receiver protein  28.73 
 
 		 542 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0174834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3390  response regulator receiver protein  28.73 
 
 		 542 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2591  transcriptional regulator, LuxR family  31.42 
 
 		 552 aa  96.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000770971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3766  response regulator receiver protein  27.44 
 
 		 539 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484632  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  45.67 
 
 		 967 aa  77.4  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  43.61 
 
 		 862 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.94 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 937 aa  74.7  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  44.72 
 
 		 916 aa  74.3  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  44.31 
 
 		 1022 aa  73.9  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  44.72 
 
 		 982 aa  73.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 231 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  45.24 
 
 		 970 aa  72.4  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.59 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  32.15 
 
 		 923 aa  70.5  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4091  LuxR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  53.03 
 
 		 242 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 216 aa  70.1  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 231 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  36.53 
 
 		 228 aa  68.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4815  transcriptional regulator, LuxR family  46.46 
 
 		 866 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.636863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.59 
 
 		 217 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2449  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.63 
 
 		 220 aa  68.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 216 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4906  response regulator receiver  65.45 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275081  normal  0.875639 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  52.44 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 212 aa  67  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 244 aa  67  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 218 aa  67  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 209 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 219 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 237 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 219 aa  66.6  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 225 aa  66.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 221 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 189 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.35 
 
 		 234 aa  66.6  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.03 
 
 		 239 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 237 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  48.35 
 
 		 959 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  55.93 
 
 		 215 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  50.75 
 
 		 234 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 881 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 525 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 222 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  51.35 
 
 		 1006 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 881 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 876 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.72 
 
 		 224 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  55.93 
 
 		 215 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 217 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  55.93 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3324  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.14 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107044  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 		 224 aa  65.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  55.93 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  55.93 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  55.93 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  55.93 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  55.93 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  43.53 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  40.18 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  39.44 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  55.93 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.61 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0277195 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  38.73 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  39.87 
 
 		 973 aa  64.7  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  58.93 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.52 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  50.75 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4518  two component LuxR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  35.95 
 
 		 964 aa  63.9  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0647  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.22 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.518884  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  52.31 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  31.88 
 
 		 893 aa  63.9  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  35.77 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.39 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 213 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.68 
 
 		 225 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>