More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2842 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2842  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 492 aa  951    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3404  transcriptional regulator, LuxR family  30.19 
 
 		 427 aa  143  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226025  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3331  transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 429 aa  127  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.573332  normal  0.222542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3710  LuxR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0091  regulatory protein LuxR  35.27 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.25 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 209 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.33 
 
 		 212 aa  66.6  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  59.62 
 
 		 921 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  59.62 
 
 		 921 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  59.62 
 
 		 921 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  57.69 
 
 		 922 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3766  response regulator receiver protein  50 
 
 		 539 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484632  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 227 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2881  response regulator receiver  49.23 
 
 		 220 aa  63.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00126066  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 226 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 224 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  54.1 
 
 		 220 aa  62.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 		 208 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 229 aa  62  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5403  transcriptional regulator, LuxR family  49.23 
 
 		 206 aa  62.4  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.497351  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.33 
 
 		 235 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  45.33 
 
 		 204 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0703  two component LuxR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 220 aa  62  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.901141  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1141  DNA-binding response regulator  45.07 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.780315  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.23 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  45.71 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  47.46 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  43.42 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3579  regulatory protein LuxR  45 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0227422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4816  response regulator receiver protein  57.41 
 
 		 248 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.890736  normal  0.794324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 234 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 204 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  47.89 
 
 		 206 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  49.21 
 
 		 207 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1727  transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 		 137 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0510322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  54.24 
 
 		 1013 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  50.77 
 
 		 207 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 230 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.48 
 
 		 221 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  47.76 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 209 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 207 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 544 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2278  LuxR response regulator receiver  57.89 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  50.77 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3900  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 592 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.573736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1571  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.78 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1197  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0485473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4147  two component LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.72 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.253855  normal  0.0592312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  47.62 
 
 		 876 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.44 
 
 		 914 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3769  transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0158689  normal  0.601222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 680 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1746  response regulator receiver protein  51.61 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4199  regulatory protein, LuxR  43.24 
 
 		 855 aa  58.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  54.39 
 
 		 1084 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  44.26 
 
 		 921 aa  57.8  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3414  LuxR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  46.48 
 
 		 907 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  29.61 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1466  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.61 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  29.61 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.46 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  42.65 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 907 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  29.61 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1496  LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  29.61 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  29.61 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.33 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  46.88 
 
 		 907 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  29.61 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.22 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  29.61 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0655  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  29.61 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  50.94 
 
 		 919 aa  57.4  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>