More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0091 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0091  regulatory protein LuxR  100 
 
 		 410 aa  804    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3710  LuxR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 426 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3404  transcriptional regulator, LuxR family  38.22 
 
 		 427 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226025  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3331  transcriptional regulator, LuxR family  39.47 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.573332  normal  0.222542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2842  transcriptional regulator, LuxR family  35.83 
 
 		 492 aa  120  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.07 
 
 		 204 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.68 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 213 aa  67  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03258  two-component system regulatory protein  53.73 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  56.16 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.68 
 
 		 218 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  50.77 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  50.77 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  50.77 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  50.77 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  50.77 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  53.52 
 
 		 188 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0906  transcriptional regulator, LuxR family  52.11 
 
 		 208 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000244022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  46.67 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  46.67 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  46.67 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  46.67 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  46.67 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0902  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.38 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0857  two component LuxR family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00237341  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3975  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0482097  normal  0.237128 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  50.77 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.71 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  44.29 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.53 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4179  hypothetical protein  49.28 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.365276 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 209 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 212 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 222 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3170  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  43.28 
 
 		 227 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  45.07 
 
 		 216 aa  62.4  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.79 
 
 		 227 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0408  two component LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2672  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.58 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.240505 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1236  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 208 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.23752  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 212 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0273  two component LuxR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4854  putative two component LuxR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3714  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1981  two component LuxR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.607794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5557  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.32 
 
 		 223 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.72 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1883  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3005  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00815247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  45.33 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  45.33 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3283  two component LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.335218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.03 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  49.28 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.306063  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1690  two component LuxR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104312 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2370  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  45.45 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0852  two component LuxR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.44 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  44 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0315  LuxR family DNA-binding response regulator  52.38 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00157  transcriptional regulator LuxR  52.54 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1611  two component LuxR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  0.234442 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3324  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.32 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107044  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0564  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  49.21 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  44 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  52.46 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  39.02 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0664  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.358413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0522  response regulator receiver protein  42.65 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4565  two component LuxR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2275  LuxR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4822  two component LuxR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0836  LuxR family two component transcriptional regulator  53.23 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0588074 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002211  transcriptional regulator LuxR family  50.85 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0920  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.22 
 
 		 221 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4715  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.525745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2525  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 215 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1543  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.23 
 
 		 221 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0960  two component LuxR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 214 aa  59.7  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 215 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 209 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3519  response regulator receiver protein  49.21 
 
 		 220 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 235 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6830  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 270 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>