More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3900 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3900  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 592 aa  1176    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.573736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0152  twin-arginine translocation pathway signal  29.29 
 
 		 432 aa  169  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0333259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1957  twin-arginine translocation pathway signal  29.67 
 
 		 433 aa  156  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.814321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2047  twin-arginine translocation pathway signal  28.75 
 
 		 431 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3054  branched-chain amino acid ABC transporter  26.3 
 
 		 426 aa  121  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.492113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  50.65 
 
 		 1006 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 207 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 213 aa  60.1  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  54.84 
 
 		 992 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 209 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 209 aa  58.9  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1102  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2842  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 799 aa  58.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45.59 
 
 		 239 aa  57  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 206 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 544 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 220 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 544 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  51.61 
 
 		 223 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0475  transcriptional regulator, LuxR family  46.97 
 
 		 123 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 544 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  48.57 
 
 		 221 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  49.18 
 
 		 215 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  49.18 
 
 		 215 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 225 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1132  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 225 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.893152  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  42 
 
 		 981 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1162  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 225 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  49.18 
 
 		 215 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0209  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 223 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 218 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  39.39 
 
 		 303 aa  55.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 554 aa  55.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  49.18 
 
 		 215 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 204 aa  55.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3765  LuxR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 140 aa  55.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.57 
 
 		 211 aa  55.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  45.71 
 
 		 864 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 900 aa  54.7  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0253  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.33 
 
 		 218 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1571  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 227 aa  54.7  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2814  LuxR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 146 aa  54.7  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  49.18 
 
 		 215 aa  54.7  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  49.18 
 
 		 215 aa  54.7  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  49.18 
 
 		 215 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 208 aa  54.3  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  49.18 
 
 		 215 aa  54.7  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  49.18 
 
 		 215 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 211 aa  54.7  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1350  LuxR family DNA-binding response regulator  39.68 
 
 		 225 aa  54.3  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00111586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  48.57 
 
 		 219 aa  54.3  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 194 aa  54.3  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 208 aa  54.3  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 225 aa  54.3  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  46.88 
 
 		 213 aa  54.3  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3310  regulatory protein, LuxR  36.19 
 
 		 512 aa  54.3  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1716  LuxR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 118 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 213 aa  54.3  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 246 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.33 
 
 		 213 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  40.26 
 
 		 211 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 209 aa  53.9  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 212 aa  53.9  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  42.86 
 
 		 209 aa  53.9  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  42.86 
 
 		 209 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 209 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 525 aa  53.9  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3760  response regulator receiver protein  47.14 
 
 		 245 aa  53.9  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358522  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 209 aa  53.9  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 215 aa  53.9  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3766  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 539 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484632  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 213 aa  53.9  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6717  transcriptional regulator, LuxR family  45.31 
 
 		 509 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 229 aa  53.9  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2902  LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 153 aa  53.9  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1651  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 218 aa  53.9  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 305 aa  53.9  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 224 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 323 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  50.82 
 
 		 206 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2754  two component LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 215 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 215 aa  53.5  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 228 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2846  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 215 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.243379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.33 
 
 		 213 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0333  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 141 aa  53.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.800894  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 209 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 215 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2938  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 215 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 229 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  50.82 
 
 		 496 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3277  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 224 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 207 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 213 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4288  metal dependent phosphohydrolase  46.77 
 
 		 519 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.472516  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 225 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>