More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3310 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3310  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 512 aa  1009    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3826  transcriptional regulator, LuxR family  53.05 
 
 		 519 aa  428  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  47.14 
 
 		 525 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2058  metal dependent phosphohydrolase  46.25 
 
 		 521 aa  361  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4288  metal dependent phosphohydrolase  46.44 
 
 		 519 aa  359  5e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.472516  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0321  transcriptional regulator, LuxR family  42.74 
 
 		 524 aa  344  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 526 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  44.9 
 
 		 526 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  44.55 
 
 		 526 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  40.19 
 
 		 516 aa  294  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1505  transcriptional regulator, LuxR family  35.98 
 
 		 522 aa  224  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6457  LuxR family transcriptional regulator  33.4 
 
 		 570 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6692  LuxR family transcriptional regulator  33.4 
 
 		 570 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5833  LuxR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 489 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6289  LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2752  metal-dependent phosphohydrolase  31.89 
 
 		 456 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204771  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 		 448 aa  184  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0229  putative metal dependent phosphohydrolase  30.99 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  31.26 
 
 		 461 aa  176  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  31.03 
 
 		 461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  29.1 
 
 		 460 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  30.29 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0009  metal dependent phosphohydrolase  24.94 
 
 		 405 aa  124  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  30.38 
 
 		 424 aa  117  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0297  metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1640  metal dependent phosphohydrolase  32.6 
 
 		 471 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  34.34 
 
 		 718 aa  100  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 		 770 aa  100  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2563  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 		 422 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30647  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  25.59 
 
 		 347 aa  98.2  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.26 
 
 		 351 aa  97.8  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2855  HDIG  27.04 
 
 		 415 aa  97.1  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  33.02 
 
 		 407 aa  97.4  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.7 
 
 		 513 aa  97.1  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  37.72 
 
 		 1171 aa  96.3  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.92 
 
 		 508 aa  94  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  33.04 
 
 		 405 aa  94  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 446 aa  94  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  36.2 
 
 		 792 aa  93.2  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  31.1 
 
 		 420 aa  92.8  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  33.16 
 
 		 431 aa  93.2  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  35.68 
 
 		 619 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  34.34 
 
 		 647 aa  90.9  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2407  HD domain-containing protein  28.52 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00855664  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.58 
 
 		 841 aa  90.5  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.94 
 
 		 368 aa  90.1  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  33.54 
 
 		 550 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  30.22 
 
 		 417 aa  89.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  35.58 
 
 		 836 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  31.73 
 
 		 760 aa  89.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  28.73 
 
 		 400 aa  89.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0891  metal dependent phosphohydrolase  33.21 
 
 		 439 aa  89.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  33.8 
 
 		 648 aa  89.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  30.57 
 
 		 339 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2833  metal dependent phosphohydrolase  39.44 
 
 		 379 aa  89  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0209293  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  38.67 
 
 		 212 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0639  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 		 210 aa  88.2  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000043249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  32.66 
 
 		 574 aa  88.6  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  30.21 
 
 		 453 aa  88.2  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0762  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 368 aa  88.2  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.218112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  33.94 
 
 		 647 aa  87.8  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0697  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 434 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  25.68 
 
 		 392 aa  87.8  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  34.43 
 
 		 635 aa  87.4  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.99 
 
 		 345 aa  87.4  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  27.33 
 
 		 434 aa  87  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  30.53 
 
 		 389 aa  87  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  38.04 
 
 		 418 aa  87  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  32.46 
 
 		 654 aa  87  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.88 
 
 		 487 aa  87  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  33.52 
 
 		 308 aa  87  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 		 420 aa  87  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  36.05 
 
 		 649 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.95 
 
 		 1073 aa  86.3  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  29.96 
 
 		 334 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  29.15 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2138  metal dependent phosphohydrolase  31.34 
 
 		 606 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.258694  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  31.84 
 
 		 651 aa  86.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 345 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0342  metal dependent phosphohydrolase  31.98 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  32.93 
 
 		 553 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  36.31 
 
 		 326 aa  85.9  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  37.18 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  36.88 
 
 		 848 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  34.32 
 
 		 1335 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  32.73 
 
 		 771 aa  85.1  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1338  metal dependent phosphohydrolase  37.11 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.427381 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  35.5 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  27.12 
 
 		 545 aa  85.1  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.33 
 
 		 492 aa  85.1  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0491  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.69 
 
 		 522 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.165576  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  35.15 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  34.36 
 
 		 1237 aa  84.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1018  metal dependent phosphohydrolase  32.61 
 
 		 652 aa  84.3  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01215  Response regulator  32.74 
 
 		 509 aa  84  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.204793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  34.46 
 
 		 636 aa  84  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  36.84 
 
 		 650 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>