More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0891 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0891  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
439 aa  893    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  42.22 
 
 
424 aa  344  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0297  metal dependent phosphohydrolase  43.06 
 
 
432 aa  336  3.9999999999999995e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309818  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0194  metal dependent phosphohydrolase  40.14 
 
 
428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0009  metal dependent phosphohydrolase  38.02 
 
 
405 aa  266  5e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2407  HD domain-containing protein  38.17 
 
 
415 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00855664  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  38.15 
 
 
420 aa  256  5e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  39.31 
 
 
418 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1338  metal dependent phosphohydrolase  37.53 
 
 
451 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.427381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1640  metal dependent phosphohydrolase  34.05 
 
 
471 aa  239  6.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2563  metal dependent phosphohydrolase  35.06 
 
 
422 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30647  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  35.78 
 
 
417 aa  229  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0342  metal dependent phosphohydrolase  31.62 
 
 
389 aa  226  9e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2855  HDIG  34.68 
 
 
415 aa  217  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 
420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0697  metal dependent phosphohydrolase  34.02 
 
 
434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2016  metal dependent phosphohydrolase  37.31 
 
 
421 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  30.96 
 
 
392 aa  204  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  33.89 
 
 
347 aa  203  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  31.85 
 
 
403 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  32.04 
 
 
422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  32.33 
 
 
425 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  32.33 
 
 
422 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  31.86 
 
 
422 aa  193  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  31.52 
 
 
434 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  34.61 
 
 
407 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  29.52 
 
 
421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  29.3 
 
 
431 aa  169  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  35.37 
 
 
450 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  30.62 
 
 
448 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2752  metal-dependent phosphohydrolase  29.21 
 
 
456 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204771  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  35.15 
 
 
461 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  35.15 
 
 
461 aa  152  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 
400 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3563  metal dependent phosphohydrolase  41.38 
 
 
205 aa  142  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  28.51 
 
 
460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0659  metal dependent phosphohydrolase  27.97 
 
 
417 aa  138  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000407587  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  41.78 
 
 
1073 aa  133  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  41.83 
 
 
539 aa  131  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0772  metal dependent phosphohydrolase  26.29 
 
 
408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0908  metal dependent phosphohydrolase  27.25 
 
 
416 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00247185  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0387  metal dependent phosphohydrolase  28.85 
 
 
454 aa  129  8.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.1 
 
 
491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0639  metal dependent phosphohydrolase  45.7 
 
 
210 aa  126  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000043249  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0886  metal dependent phosphohydrolase  27.68 
 
 
416 aa  126  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00322853  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.88 
 
 
364 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1765  metal dependent phosphohydrolase  27.11 
 
 
436 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  33.65 
 
 
424 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0208  metal dependent phosphohydrolase  41.56 
 
 
229 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  38.36 
 
 
467 aa  124  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  41.55 
 
 
177 aa  121  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 
339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  38.12 
 
 
547 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  38.12 
 
 
547 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1432  metal dependent phosphohydrolase  38.79 
 
 
207 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000116071  normal  0.0291247 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  36.42 
 
 
428 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  36.99 
 
 
428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  42.38 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  33.65 
 
 
505 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  35.44 
 
 
495 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  37.04 
 
 
220 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3082  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.74 
 
 
550 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000925788 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
770 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  40.62 
 
 
647 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  33.54 
 
 
470 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  39.04 
 
 
545 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 
363 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  44.16 
 
 
574 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  38.56 
 
 
465 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1151  metal dependent phosphohydrolase  38.42 
 
 
248 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505397  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1236  metal dependent phosphohydrolase  39.44 
 
 
574 aa  114  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0497288  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  41.38 
 
 
876 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  42.95 
 
 
647 aa  114  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  35.53 
 
 
452 aa  113  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2505  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.01 
 
 
610 aa  113  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  33.92 
 
 
525 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0261  metal dependent phosphohydrolase  41.33 
 
 
245 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  40.24 
 
 
419 aa  112  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
710 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  35.19 
 
 
611 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  41.78 
 
 
438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  39.75 
 
 
518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0910  metal dependent phosphohydrolase  36.18 
 
 
561 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.69967  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1513  metal dependent phosphohydrolase  45.1 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.52 
 
 
367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  38.92 
 
 
320 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  39.11 
 
 
635 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  38.51 
 
 
771 aa  111  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  39.75 
 
 
718 aa  111  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  39.01 
 
 
197 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.65 
 
 
480 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.9 
 
 
328 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  36.05 
 
 
403 aa  111  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  39.19 
 
 
516 aa  111  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  35.62 
 
 
414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  37.84 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 
446 aa  110  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  43.15 
 
 
388 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  33.13 
 
 
545 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  37.36 
 
 
436 aa  110  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>