More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0321 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0321  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 524 aa  1011    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4288  metal dependent phosphohydrolase  51.17 
 
 		 519 aa  433  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.472516  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2058  metal dependent phosphohydrolase  50.49 
 
 		 521 aa  423  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 526 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  50.59 
 
 		 526 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  50.59 
 
 		 526 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  48.54 
 
 		 525 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3310  regulatory protein, LuxR  43.85 
 
 		 512 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3826  transcriptional regulator, LuxR family  45.93 
 
 		 519 aa  365  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  40.46 
 
 		 516 aa  299  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  33.1 
 
 		 450 aa  212  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5833  LuxR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 489 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2752  metal-dependent phosphohydrolase  31.59 
 
 		 456 aa  204  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204771  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0229  putative metal dependent phosphohydrolase  33.92 
 
 		 474 aa  203  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1505  transcriptional regulator, LuxR family  32.23 
 
 		 522 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6457  LuxR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 570 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6692  LuxR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 570 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  31.47 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 448 aa  190  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6289  LuxR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 515 aa  190  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  31 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  28.41 
 
 		 460 aa  188  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0009  metal dependent phosphohydrolase  24.65 
 
 		 405 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  25.71 
 
 		 347 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  33.08 
 
 		 407 aa  124  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  33.12 
 
 		 420 aa  124  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  26.43 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  25.96 
 
 		 424 aa  118  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  22.94 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2407  HD domain-containing protein  28.67 
 
 		 415 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00855664  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 		 403 aa  113  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  31.08 
 
 		 420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  28.88 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  25.49 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  29.39 
 
 		 417 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2563  metal dependent phosphohydrolase  29.39 
 
 		 422 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30647  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  33.92 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  30.98 
 
 		 647 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  32.02 
 
 		 421 aa  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0891  metal dependent phosphohydrolase  29.24 
 
 		 439 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 		 647 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 		 487 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 		 367 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  30.39 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0194  metal dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 		 428 aa  100  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  35.06 
 
 		 635 aa  100  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.44 
 
 		 491 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  34.3 
 
 		 550 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.02 
 
 		 364 aa  98.6  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  27.63 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  34.3 
 
 		 619 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0297  metal dependent phosphohydrolase  25.52 
 
 		 432 aa  98.2  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2016  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 		 421 aa  97.8  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  28.63 
 
 		 422 aa  97.1  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  29.11 
 
 		 770 aa  96.3  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  32.52 
 
 		 1171 aa  96.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  32.16 
 
 		 710 aa  96.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  33.55 
 
 		 636 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  30.07 
 
 		 648 aa  95.5  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  33.92 
 
 		 212 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.18 
 
 		 480 aa  95.9  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  31.9 
 
 		 848 aa  95.9  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 		 713 aa  95.1  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  30.5 
 
 		 453 aa  94.4  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  30 
 
 		 760 aa  94.4  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  28.81 
 
 		 430 aa  94.4  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  26.9 
 
 		 334 aa  94.4  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  25.22 
 
 		 718 aa  93.6  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  32.16 
 
 		 698 aa  93.2  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  31.55 
 
 		 792 aa  93.2  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 		 513 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.48 
 
 		 506 aa  93.2  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2138  metal dependent phosphohydrolase  31 
 
 		 606 aa  93.2  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.258694  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  29.94 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  31.05 
 
 		 574 aa  92.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  30.21 
 
 		 359 aa  92  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  31.65 
 
 		 553 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 		 508 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.19 
 
 		 853 aa  92.4  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  33.54 
 
 		 1237 aa  92.4  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.87 
 
 		 384 aa  92.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  28.48 
 
 		 547 aa  92.4  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  28.48 
 
 		 547 aa  92.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  27.46 
 
 		 434 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.21 
 
 		 841 aa  91.7  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 		 496 aa  92  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 		 446 aa  91.7  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  28.51 
 
 		 425 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  28.51 
 
 		 422 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2855  HDIG  31.95 
 
 		 415 aa  90.9  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 		 487 aa  90.9  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  28.51 
 
 		 422 aa  90.5  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  25.95 
 
 		 465 aa  90.5  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  36.3 
 
 		 331 aa  90.5  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 498 aa  90.5  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.97 
 
 		 492 aa  90.1  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  30.68 
 
 		 836 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  34.71 
 
 		 311 aa  89  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  35.76 
 
 		 451 aa  89  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  28.32 
 
 		 366 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>