More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2855 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2855  HDIG  100 
 
 		 415 aa  841    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  42.72 
 
 		 417 aa  346  5e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  35.87 
 
 		 421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  36.34 
 
 		 422 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  34.7 
 
 		 434 aa  266  7e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 422 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  34.15 
 
 		 431 aa  260  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 425 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 422 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0297  metal dependent phosphohydrolase  35.85 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0009  metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 		 405 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  34.16 
 
 		 424 aa  237  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  35.21 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2407  HD domain-containing protein  33.86 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00855664  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0194  metal dependent phosphohydrolase  32.02 
 
 		 428 aa  219  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0891  metal dependent phosphohydrolase  34.68 
 
 		 439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0697  metal dependent phosphohydrolase  32.49 
 
 		 434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1338  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 		 451 aa  196  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.427381 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  32.64 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  31.35 
 
 		 392 aa  192  9e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  32.91 
 
 		 418 aa  192  9e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  32.08 
 
 		 403 aa  189  5.999999999999999e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 		 407 aa  189  9e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2563  metal dependent phosphohydrolase  32.47 
 
 		 422 aa  179  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30647  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2016  metal dependent phosphohydrolase  32.98 
 
 		 421 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 		 420 aa  166  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1640  metal dependent phosphohydrolase  29.16 
 
 		 471 aa  166  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0342  metal dependent phosphohydrolase  28.38 
 
 		 389 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 		 400 aa  156  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 461 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  31.53 
 
 		 450 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  29.77 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2752  metal-dependent phosphohydrolase  33.72 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204771  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  39.33 
 
 		 635 aa  127  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  33.96 
 
 		 516 aa  126  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0659  metal dependent phosphohydrolase  26.87 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000407587  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  39.38 
 
 		 611 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1705  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.38 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  33.71 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1765  metal dependent phosphohydrolase  25.78 
 
 		 436 aa  124  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286355  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0908  metal dependent phosphohydrolase  26.05 
 
 		 416 aa  123  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00247185  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  35.8 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0208  metal dependent phosphohydrolase  42.08 
 
 		 229 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0772  metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  36.75 
 
 		 545 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  38.55 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 		 574 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  32.68 
 
 		 424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  35.23 
 
 		 428 aa  119  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 		 547 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 		 547 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  34.32 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0886  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 		 416 aa  117  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00322853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4027  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 		 346 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247639  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.9 
 
 		 513 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  40.49 
 
 		 836 aa  116  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  40.49 
 
 		 792 aa  116  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.08 
 
 		 841 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1204  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 		 553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  26.81 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  32.58 
 
 		 648 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0497  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.88 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  34.71 
 
 		 770 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.58 
 
 		 1073 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.75 
 
 		 491 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  42.14 
 
 		 197 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0387  metal dependent phosphohydrolase  28.32 
 
 		 454 aa  113  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  35.08 
 
 		 539 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  37.97 
 
 		 647 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  37.97 
 
 		 647 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 		 414 aa  112  9e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 		 553 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.96 
 
 		 496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  40.28 
 
 		 632 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  36.65 
 
 		 760 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  36.57 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.91 
 
 		 508 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  34.34 
 
 		 698 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1152  metal dependent phosphohydrolase  39.35 
 
 		 565 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000790776  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0978  metal dependent phosphohydrolase  39.35 
 
 		 558 aa  111  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000628602  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2306  metal dependent phosphohydrolase  35.12 
 
 		 531 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  36.88 
 
 		 518 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  38.2 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1099  metal dependent phosphohydrolase  35.15 
 
 		 572 aa  110  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00025429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2094  response regulator  30.18 
 
 		 329 aa  110  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.37 
 
 		 480 aa  110  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  38.92 
 
 		 371 aa  109  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.22 
 
 		 487 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.81 
 
 		 364 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  33.49 
 
 		 550 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  36.25 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  35.54 
 
 		 615 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1018  metal dependent phosphohydrolase  41.04 
 
 		 652 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.31 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.19 
 
 		 506 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  36.54 
 
 		 654 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  38.62 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>