More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2563 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2563  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
422 aa  877    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30647  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  39.35 
 
 
424 aa  276  6e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0297  metal dependent phosphohydrolase  36.1 
 
 
432 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309818  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0891  metal dependent phosphohydrolase  35.06 
 
 
439 aa  232  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0009  metal dependent phosphohydrolase  36.04 
 
 
405 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  37.74 
 
 
420 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 
418 aa  221  3e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  36.24 
 
 
392 aa  219  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0194  metal dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 
428 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2407  HD domain-containing protein  33.68 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00855664  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1640  metal dependent phosphohydrolase  33.17 
 
 
471 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  34.24 
 
 
420 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0697  metal dependent phosphohydrolase  35.12 
 
 
434 aa  206  8e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  33.51 
 
 
417 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1338  metal dependent phosphohydrolase  33.67 
 
 
451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.427381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2855  HDIG  32.47 
 
 
415 aa  179  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 
347 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  32.77 
 
 
407 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2016  metal dependent phosphohydrolase  31.96 
 
 
421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  30.16 
 
 
403 aa  166  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  31.65 
 
 
421 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0342  metal dependent phosphohydrolase  31.51 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  30.03 
 
 
431 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  30.42 
 
 
434 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 
422 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  30.75 
 
 
422 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  31.93 
 
 
422 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  31.44 
 
 
425 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0387  metal dependent phosphohydrolase  29.97 
 
 
454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  34.3 
 
 
461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  34.3 
 
 
461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0772  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0886  metal dependent phosphohydrolase  26.11 
 
 
416 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00322853  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0908  metal dependent phosphohydrolase  26.86 
 
 
416 aa  123  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00247185  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 
450 aa  120  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.75 
 
 
1073 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1765  metal dependent phosphohydrolase  26.14 
 
 
436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1949  metal dependent phosphohydrolase  38.93 
 
 
226 aa  111  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000478205  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  30.45 
 
 
417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  37.35 
 
 
460 aa  110  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2752  metal-dependent phosphohydrolase  30.55 
 
 
456 aa  110  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204771  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  38.25 
 
 
574 aa  110  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  28.31 
 
 
448 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  35.09 
 
 
618 aa  107  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0838  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.05 
 
 
378 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  35.58 
 
 
311 aa  107  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2366  response regulator  33.51 
 
 
525 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0659  metal dependent phosphohydrolase  36.42 
 
 
417 aa  106  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000407587  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  26.16 
 
 
405 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  38.26 
 
 
400 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  35.35 
 
 
399 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  36.97 
 
 
650 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  33.87 
 
 
770 aa  104  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1432  metal dependent phosphohydrolase  37.58 
 
 
207 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000116071  normal  0.0291247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  36.2 
 
 
649 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  36.92 
 
 
413 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  34.69 
 
 
1237 aa  103  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  35.64 
 
 
247 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  33.17 
 
 
446 aa  103  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  36.31 
 
 
539 aa  103  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 
615 aa  103  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  31.9 
 
 
390 aa  102  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2105  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.14 
 
 
525 aa  102  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00173233  normal  0.407049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  31.21 
 
 
389 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  36.97 
 
 
619 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  31.77 
 
 
306 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
414 aa  102  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.65 
 
 
351 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
401 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  34.81 
 
 
740 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 
545 aa  101  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2004  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 
525 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0562345  hitchhiker  0.000000282251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1971  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 
525 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0825869  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  33.8 
 
 
177 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 
345 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  32.42 
 
 
357 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1183  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.52 
 
 
363 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  35.47 
 
 
366 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  30.46 
 
 
400 aa  100  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  36.2 
 
 
212 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  33.55 
 
 
495 aa  100  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3313  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 
343 aa  100  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.94 
 
 
496 aa  99.8  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3117  metal dependent phosphohydrolase  35.33 
 
 
868 aa  99.8  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.411683  normal  0.363109 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1151  metal dependent phosphohydrolase  31.42 
 
 
248 aa  99.8  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  34.42 
 
 
197 aa  99.8  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3563  metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 
205 aa  99.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1019  putative response regulator  33.51 
 
 
522 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3219  putative PAS/PAC sensor protein  38.55 
 
 
793 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  36.2 
 
 
1171 aa  98.6  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 
452 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2325  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
362 aa  98.6  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.663275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2803  metal dependent phosphohydrolase  33.71 
 
 
448 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361766  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3310  regulatory protein, LuxR  31.82 
 
 
512 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4485  hypothetical protein  31.15 
 
 
523 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2212  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.15 
 
 
523 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.16257  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2199  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.15 
 
 
523 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.179718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  37.35 
 
 
710 aa  97.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  30.74 
 
 
516 aa  97.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2545  metal dependent phosphohydrolase  36.28 
 
 
269 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>