More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3563 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3563  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
205 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0194  metal dependent phosphohydrolase  42.93 
 
 
428 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  38.27 
 
 
424 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0297  metal dependent phosphohydrolase  41.4 
 
 
432 aa  159  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309818  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0891  metal dependent phosphohydrolase  41.38 
 
 
439 aa  142  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0009  metal dependent phosphohydrolase  35.52 
 
 
405 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 
420 aa  102  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  32.46 
 
 
418 aa  101  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2563  metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 
422 aa  99.4  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30647  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2407  HD domain-containing protein  30.65 
 
 
415 aa  98.2  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00855664  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1338  metal dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 
451 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.427381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2855  HDIG  34.04 
 
 
415 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0697  metal dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 
434 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2016  metal dependent phosphohydrolase  34.1 
 
 
421 aa  91.3  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  25.87 
 
 
392 aa  85.1  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  28.43 
 
 
417 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  31.74 
 
 
407 aa  82  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0342  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1640  metal dependent phosphohydrolase  28.04 
 
 
471 aa  76.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  29.53 
 
 
876 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  26.9 
 
 
431 aa  72  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  27.14 
 
 
422 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 
389 aa  68.9  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
320 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2111  metal dependent phosphohydrolase  29.48 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.18 
 
 
480 aa  68.6  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  36.52 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0387  metal dependent phosphohydrolase  30.99 
 
 
454 aa  67  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1432  metal dependent phosphohydrolase  27.03 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000116071  normal  0.0291247 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  26.56 
 
 
452 aa  65.5  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.1 
 
 
368 aa  65.1  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  25.77 
 
 
434 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0188  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 
279 aa  65.1  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.691401  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0190  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 
279 aa  65.1  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.780552  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0497  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 
432 aa  64.7  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  27.12 
 
 
220 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  26.63 
 
 
550 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  26.15 
 
 
387 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  26.46 
 
 
334 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 
320 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.12 
 
 
357 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0762  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 
368 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.218112  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.48 
 
 
384 aa  62.8  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0523  Response regulator protein  30.72 
 
 
359 aa  62  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  27.84 
 
 
1073 aa  62  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  26.46 
 
 
334 aa  61.2  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  28.41 
 
 
438 aa  61.2  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 
483 aa  61.2  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 
491 aa  61.2  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5340  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.77 
 
 
348 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2450  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  29.44 
 
 
617 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
364 aa  60.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  26.09 
 
 
599 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.47 
 
 
506 aa  60.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  29.32 
 
 
547 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1328  metal dependent phosphohydrolase  27.41 
 
 
268 aa  60.1  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 
553 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 
334 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  25.96 
 
 
334 aa  60.1  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  29.32 
 
 
547 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1507  putative PAS/PAC sensor protein  26.5 
 
 
357 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000751678  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.07 
 
 
498 aa  59.7  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1560  metal dependent phosphohydrolase  29.27 
 
 
317 aa  59.3  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  26.78 
 
 
428 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  25.71 
 
 
563 aa  59.3  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  26.35 
 
 
197 aa  59.3  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  24.21 
 
 
564 aa  58.9  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0796  metal dependent phosphohydrolase  29.02 
 
 
263 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.63 
 
 
487 aa  58.5  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  27.17 
 
 
545 aa  58.2  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  25.51 
 
 
771 aa  58.2  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  27.46 
 
 
648 aa  58.2  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 
343 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  24.1 
 
 
350 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2264  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  26.06 
 
 
719 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000689674  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 
718 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  30.59 
 
 
650 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  27.46 
 
 
1301 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.65 
 
 
348 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00581699  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  26.53 
 
 
347 aa  56.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1151  metal dependent phosphohydrolase  28.72 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505397  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  25.81 
 
 
453 aa  56.6  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  29.29 
 
 
495 aa  56.6  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  28.9 
 
 
548 aa  55.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1158  metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 
314 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0208  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 
229 aa  55.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2835  putative PAS/PAC sensor protein  30.22 
 
 
452 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0837096  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  23.32 
 
 
389 aa  55.8  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2224  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  28.48 
 
 
500 aa  55.5  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000178543  decreased coverage  1.10821e-21 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  27.33 
 
 
357 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0726  metal dependent phosphohydrolase  26.34 
 
 
269 aa  55.5  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  28.03 
 
 
545 aa  55.1  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  25.17 
 
 
446 aa  55.1  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2457  metal dependent phosphohydrolase  28.1 
 
 
358 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  26.56 
 
 
403 aa  55.1  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_002936  DET1049  HD domain-containing protein  27.51 
 
 
311 aa  54.7  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0090576  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4105  metal dependent phosphohydrolase  29.27 
 
 
199 aa  55.1  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000135531  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.49 
 
 
449 aa  55.1  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247955  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  24.85 
 
 
814 aa  54.7  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0273  metal dependent phosphohydrolase  27.88 
 
 
534 aa  54.7  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.576727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>