More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0995 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
418 aa  840    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0697  metal dependent phosphohydrolase  49.02 
 
 
434 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  39.61 
 
 
424 aa  293  5e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0297  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 
432 aa  253  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309818  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0891  metal dependent phosphohydrolase  39.31 
 
 
439 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  38.56 
 
 
420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2407  HD domain-containing protein  35.98 
 
 
415 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00855664  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0194  metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 
428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1338  metal dependent phosphohydrolase  38.5 
 
 
451 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.427381 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0009  metal dependent phosphohydrolase  33.86 
 
 
405 aa  232  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  33.07 
 
 
392 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1640  metal dependent phosphohydrolase  32.94 
 
 
471 aa  222  7e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2563  metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 
422 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30647  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  32.39 
 
 
417 aa  212  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  34.24 
 
 
422 aa  212  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  34.65 
 
 
422 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  34.65 
 
 
425 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  34.9 
 
 
407 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  38.22 
 
 
420 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  32.83 
 
 
422 aa  205  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2016  metal dependent phosphohydrolase  37.28 
 
 
421 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  34.34 
 
 
403 aa  196  6e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  31.28 
 
 
421 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2855  HDIG  32.91 
 
 
415 aa  192  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0342  metal dependent phosphohydrolase  29.59 
 
 
389 aa  186  9e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  32.25 
 
 
347 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  27.55 
 
 
431 aa  177  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0772  metal dependent phosphohydrolase  27.99 
 
 
408 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 
400 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0886  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 
416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00322853  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0908  metal dependent phosphohydrolase  28.21 
 
 
416 aa  136  8e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00247185  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  26.46 
 
 
448 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  26.65 
 
 
450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.95 
 
 
1073 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1765  metal dependent phosphohydrolase  26.74 
 
 
436 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286355  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0387  metal dependent phosphohydrolase  31.9 
 
 
454 aa  124  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  26.82 
 
 
461 aa  121  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  26.82 
 
 
461 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.92 
 
 
367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0659  metal dependent phosphohydrolase  25.89 
 
 
417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000407587  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  39.53 
 
 
635 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  31.49 
 
 
545 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.47 
 
 
328 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2752  metal-dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 
456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204771  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  35.36 
 
 
710 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 
414 aa  113  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.78 
 
 
364 aa  113  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  32.57 
 
 
470 aa  113  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0208  metal dependent phosphohydrolase  32.37 
 
 
229 aa  113  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  35.9 
 
 
770 aa  113  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 
647 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  34.16 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  33.73 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  36.18 
 
 
574 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2655  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.41 
 
 
351 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  34.18 
 
 
525 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  38.62 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  38.06 
 
 
647 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  38.04 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  34.68 
 
 
516 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  38.51 
 
 
650 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.13 
 
 
491 aa  110  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  36.47 
 
 
405 aa  109  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  40.14 
 
 
1301 aa  109  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1151  metal dependent phosphohydrolase  40.85 
 
 
248 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505397  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.74 
 
 
363 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  37.58 
 
 
424 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0796  metal dependent phosphohydrolase  32.19 
 
 
263 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  40.28 
 
 
465 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3082  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.5 
 
 
550 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000925788 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  37.58 
 
 
308 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  39.47 
 
 
571 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
212 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  34.59 
 
 
460 aa  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2366  response regulator  39.1 
 
 
525 aa  107  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2505  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  38.85 
 
 
610 aa  107  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  39.22 
 
 
654 aa  107  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  35.75 
 
 
771 aa  107  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2105  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.74 
 
 
525 aa  106  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00173233  normal  0.407049 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2004  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.1 
 
 
525 aa  106  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0562345  hitchhiker  0.000000282251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1971  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.1 
 
 
525 aa  106  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0825869  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  37.32 
 
 
389 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  36.17 
 
 
177 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  37.75 
 
 
713 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.58 
 
 
345 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  37.35 
 
 
619 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  43.7 
 
 
419 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1099  metal dependent phosphohydrolase  36.55 
 
 
572 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00025429  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  40.6 
 
 
419 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3219  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 
793 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2325  metal dependent phosphohydrolase  25.26 
 
 
419 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 
467 aa  105  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1828  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.22 
 
 
379 aa  104  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  36.17 
 
 
334 aa  104  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1705  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.35 
 
 
471 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  41.04 
 
 
409 aa  104  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1236  metal dependent phosphohydrolase  35.17 
 
 
574 aa  104  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0497288  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  35 
 
 
876 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>