More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1412 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  98.7 
 
 
461 aa  926    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
461 aa  934    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2752  metal-dependent phosphohydrolase  64.92 
 
 
456 aa  593  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204771  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  55.17 
 
 
448 aa  519  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  52.9 
 
 
460 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  49.77 
 
 
450 aa  420  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  34.84 
 
 
525 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  36.06 
 
 
516 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3310  regulatory protein, LuxR  31.26 
 
 
512 aa  183  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 
347 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0321  transcriptional regulator, LuxR family  30.48 
 
 
524 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2058  metal dependent phosphohydrolase  33.41 
 
 
521 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
526 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  31.86 
 
 
526 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4288  metal dependent phosphohydrolase  33.02 
 
 
519 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.472516  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  31.86 
 
 
526 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3826  transcriptional regulator, LuxR family  32.54 
 
 
519 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553807  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0009  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  32.28 
 
 
420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  38.13 
 
 
400 aa  172  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  27.66 
 
 
392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  28.89 
 
 
403 aa  166  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  42.94 
 
 
547 aa  162  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  42.94 
 
 
547 aa  162  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  45.2 
 
 
718 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  41.53 
 
 
428 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  48.17 
 
 
539 aa  156  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  45.09 
 
 
713 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  40.31 
 
 
518 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  45.03 
 
 
698 aa  154  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0891  metal dependent phosphohydrolase  35.15 
 
 
439 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  41.18 
 
 
1171 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  44.25 
 
 
545 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  47.25 
 
 
574 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2016  metal dependent phosphohydrolase  37.6 
 
 
421 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  41.11 
 
 
648 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  43.24 
 
 
571 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0639  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
345 aa  151  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2855  HDIG  33.33 
 
 
415 aa  150  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  43.71 
 
 
366 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 
452 aa  150  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  40.38 
 
 
712 aa  149  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  33.66 
 
 
407 aa  149  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  32.1 
 
 
431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  43.93 
 
 
632 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0653  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49.4 
 
 
345 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6785900000000002e-24 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2407  HD domain-containing protein  29.38 
 
 
415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00855664  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  42.22 
 
 
636 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  45.35 
 
 
407 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  42.16 
 
 
553 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1338  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 
451 aa  148  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.427381 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  45.2 
 
 
331 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  41.08 
 
 
740 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  44.05 
 
 
371 aa  147  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  44.24 
 
 
545 aa  147  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  41.32 
 
 
647 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0297  metal dependent phosphohydrolase  27.86 
 
 
432 aa  146  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309818  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  36.41 
 
 
363 aa  146  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.4 
 
 
506 aa  146  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0194  metal dependent phosphohydrolase  25.23 
 
 
428 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.88 
 
 
487 aa  144  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  42.46 
 
 
550 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  40.62 
 
 
710 aa  144  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  43.58 
 
 
635 aa  144  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  43.6 
 
 
876 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  43.02 
 
 
465 aa  143  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  40.72 
 
 
647 aa  143  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3169  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.44 
 
 
353 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821118  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  42.93 
 
 
650 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  41.71 
 
 
247 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  41.34 
 
 
499 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  38.57 
 
 
505 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  45.66 
 
 
509 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  40.76 
 
 
451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  44.51 
 
 
469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  39.53 
 
 
692 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  28.66 
 
 
421 aa  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  45.45 
 
 
326 aa  141  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  44.02 
 
 
387 aa  141  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.23 
 
 
348 aa  141  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00581699  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2094  response regulator  42.29 
 
 
329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  43.03 
 
 
611 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.76 
 
 
450 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  41.14 
 
 
349 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  27.9 
 
 
424 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  37.7 
 
 
703 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  40.91 
 
 
339 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  41.57 
 
 
1237 aa  139  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 
495 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  36.41 
 
 
422 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  40.61 
 
 
710 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  38.86 
 
 
389 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  39.56 
 
 
424 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0838  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.24 
 
 
378 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  37.17 
 
 
703 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7735  metal dependent phosphohydrolase  43.52 
 
 
905 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  44.31 
 
 
428 aa  139  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  43.71 
 
 
428 aa  138  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  42.01 
 
 
836 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.45 
 
 
357 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>