More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1147 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  83.41 
 
 		 422 aa  741    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  80.48 
 
 		 434 aa  713    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 425 aa  869    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 422 aa  871    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  97.39 
 
 		 422 aa  847    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  51.46 
 
 		 421 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  46.96 
 
 		 431 aa  396  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  38.57 
 
 		 417 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2855  HDIG  35.71 
 
 		 415 aa  260  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  34.65 
 
 		 418 aa  210  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2407  HD domain-containing protein  33.33 
 
 		 415 aa  209  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00855664  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  33.17 
 
 		 420 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  32.83 
 
 		 424 aa  205  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0009  metal dependent phosphohydrolase  31.99 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0891  metal dependent phosphohydrolase  32.33 
 
 		 439 aa  196  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0297  metal dependent phosphohydrolase  31.77 
 
 		 432 aa  192  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  31.7 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0194  metal dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 		 428 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1338  metal dependent phosphohydrolase  32.66 
 
 		 451 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.427381 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  31.44 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 		 403 aa  173  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2016  metal dependent phosphohydrolase  32.98 
 
 		 421 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  31.7 
 
 		 420 aa  170  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1640  metal dependent phosphohydrolase  30.32 
 
 		 471 aa  167  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  32.6 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0697  metal dependent phosphohydrolase  29.14 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0342  metal dependent phosphohydrolase  28.35 
 
 		 389 aa  156  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2563  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 		 422 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30647  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1765  metal dependent phosphohydrolase  30.79 
 
 		 436 aa  150  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286355  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  34.05 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  34.84 
 
 		 450 aa  147  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  32.41 
 
 		 403 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  36.45 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  36.11 
 
 		 460 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  36.45 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0886  metal dependent phosphohydrolase  29.16 
 
 		 416 aa  134  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00322853  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  45.89 
 
 		 467 aa  134  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  30.36 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2752  metal-dependent phosphohydrolase  32.77 
 
 		 456 aa  131  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204771  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  40.8 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  39.51 
 
 		 635 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0908  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 416 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00247185  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  40.23 
 
 		 428 aa  127  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  38.15 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0387  metal dependent phosphohydrolase  30.17 
 
 		 454 aa  123  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0208  metal dependent phosphohydrolase  37.06 
 
 		 229 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  42.38 
 
 		 770 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0772  metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 		 408 aa  120  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  35.6 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  40.67 
 
 		 876 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2306  metal dependent phosphohydrolase  37.28 
 
 		 531 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  38.65 
 
 		 470 aa  116  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  32.76 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  41.83 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 545 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  35.42 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  39.24 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  40.65 
 
 		 539 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  39.6 
 
 		 366 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.37 
 
 		 328 aa  113  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.42 
 
 		 480 aa  113  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  40.97 
 
 		 177 aa  112  8.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 		 611 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  37.43 
 
 		 636 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0492  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 508 aa  111  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0844408  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4027  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.41 
 
 		 346 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  35.36 
 
 		 632 aa  110  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.54 
 
 		 487 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1406  response regulator  35.98 
 
 		 351 aa  109  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1151  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505397  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.41 
 
 		 868 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0659  metal dependent phosphohydrolase  25.13 
 
 		 417 aa  109  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000407587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  36.54 
 
 		 518 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3408  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.04 
 
 		 346 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  38.06 
 
 		 710 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  37.82 
 
 		 654 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1705  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 		 471 aa  109  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  38.31 
 
 		 424 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  35.88 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3114  metal dependent phosphohydrolase  32.72 
 
 		 523 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00390297  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1019  putative response regulator  33.96 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  38.2 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.88 
 
 		 491 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1158  metal dependent phosphohydrolase  37.1 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 		 496 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0679  response regulator receiver  36.78 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.18 
 
 		 506 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3285  response regulator receiver  36.17 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.67 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  34.15 
 
 		 647 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  36.67 
 
 		 648 aa  107  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0899  hypothetical protein  35.71 
 
 		 294 aa  106  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000973065 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3001  metal dependent phosphohydrolase  34.64 
 
 		 420 aa  107  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.93 
 
 		 351 aa  106  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1183  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.54 
 
 		 363 aa  106  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  33.55 
 
 		 563 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  34.59 
 
 		 548 aa  106  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  34.15 
 
 		 647 aa  106  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  35.57 
 
 		 345 aa  106  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  33.85 
 
 		 550 aa  106  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>