More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003575 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  100 
 
 		 421 aa  885    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  53.58 
 
 		 422 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  51.46 
 
 		 425 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  51.46 
 
 		 422 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  50.73 
 
 		 422 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  50.99 
 
 		 434 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  44.83 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  39.16 
 
 		 417 aa  293  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2855  HDIG  35.87 
 
 		 415 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0009  metal dependent phosphohydrolase  31.6 
 
 		 405 aa  206  8e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  29.67 
 
 		 420 aa  203  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2407  HD domain-containing protein  31.87 
 
 		 415 aa  202  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00855664  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 		 418 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0297  metal dependent phosphohydrolase  31.14 
 
 		 432 aa  189  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  31.85 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2016  metal dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 		 421 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 		 347 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0194  metal dependent phosphohydrolase  30.98 
 
 		 428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0891  metal dependent phosphohydrolase  29.52 
 
 		 439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1338  metal dependent phosphohydrolase  32.38 
 
 		 451 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.427381 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 		 420 aa  177  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0697  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1640  metal dependent phosphohydrolase  29.21 
 
 		 471 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  35.95 
 
 		 450 aa  166  9e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2563  metal dependent phosphohydrolase  31.65 
 
 		 422 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30647  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 		 407 aa  162  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0342  metal dependent phosphohydrolase  28.68 
 
 		 389 aa  159  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0908  metal dependent phosphohydrolase  30.4 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00247185  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0886  metal dependent phosphohydrolase  31.08 
 
 		 416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00322853  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  27.91 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  31.61 
 
 		 460 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  28.66 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  28.66 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  30.32 
 
 		 448 aa  137  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0772  metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 		 408 aa  133  5e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  30.62 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  37.78 
 
 		 403 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2752  metal-dependent phosphohydrolase  29.6 
 
 		 456 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204771  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  42.21 
 
 		 428 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  44.37 
 
 		 635 aa  127  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1765  metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 		 436 aa  127  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286355  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  41.56 
 
 		 428 aa  127  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0659  metal dependent phosphohydrolase  29.43 
 
 		 417 aa  126  8.000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000407587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  34.47 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.53 
 
 		 364 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 		 405 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  39.88 
 
 		 499 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  36.31 
 
 		 414 aa  119  9e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.02 
 
 		 1073 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  37.35 
 
 		 876 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  39.76 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  37.04 
 
 		 545 aa  118  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  37.19 
 
 		 525 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0208  metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 		 229 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0387  metal dependent phosphohydrolase  26.98 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1151  metal dependent phosphohydrolase  38.75 
 
 		 248 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505397  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 		 770 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  38.15 
 
 		 760 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  37.74 
 
 		 539 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 496 aa  112  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  38.92 
 
 		 771 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.06 
 
 		 506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  37.11 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  37.04 
 
 		 574 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3421  putative PAS/PAC sensor protein  40.14 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  34.9 
 
 		 550 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 		 713 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.85 
 
 		 480 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  38.36 
 
 		 467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  33.84 
 
 		 518 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.43 
 
 		 487 aa  111  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  45.93 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  38.26 
 
 		 547 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  35.8 
 
 		 177 aa  110  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  38.26 
 
 		 547 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1344  metal dependent phosphohydrolase  35.12 
 
 		 643 aa  110  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  38.73 
 
 		 611 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 		 328 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  40.41 
 
 		 465 aa  110  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  40.43 
 
 		 698 aa  110  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2306  metal dependent phosphohydrolase  40.14 
 
 		 531 aa  109  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  34.33 
 
 		 369 aa  109  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1705  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.76 
 
 		 471 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  40.85 
 
 		 446 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  37.32 
 
 		 373 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1355  metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  39.46 
 
 		 647 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  39.31 
 
 		 632 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  39.33 
 
 		 1237 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  39.46 
 
 		 647 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  37.42 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  34.3 
 
 		 636 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  40.56 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.72 
 
 		 498 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  42.25 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  40.85 
 
 		 350 aa  108  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>