More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1189 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  79.57 
 
 
422 aa  702    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  79.53 
 
 
425 aa  714    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  80.48 
 
 
422 aa  713    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
434 aa  899    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  79.76 
 
 
422 aa  709    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  50.99 
 
 
421 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  44.6 
 
 
431 aa  388  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  38.01 
 
 
417 aa  272  9e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2855  HDIG  34.7 
 
 
415 aa  266  8e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0297  metal dependent phosphohydrolase  32.86 
 
 
432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309818  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2407  HD domain-containing protein  32.63 
 
 
415 aa  207  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00855664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0009  metal dependent phosphohydrolase  32.41 
 
 
405 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  30.49 
 
 
424 aa  204  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  31.66 
 
 
420 aa  192  8e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0891  metal dependent phosphohydrolase  31.52 
 
 
439 aa  189  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0194  metal dependent phosphohydrolase  30.6 
 
 
428 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  30.85 
 
 
392 aa  183  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1338  metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 
451 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.427381 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  32.73 
 
 
420 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  31.38 
 
 
347 aa  173  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  29.95 
 
 
403 aa  169  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1640  metal dependent phosphohydrolase  29.7 
 
 
471 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2016  metal dependent phosphohydrolase  31.23 
 
 
421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0697  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 
434 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
407 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2563  metal dependent phosphohydrolase  30.42 
 
 
422 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30647  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0342  metal dependent phosphohydrolase  26.9 
 
 
389 aa  149  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 
450 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
400 aa  143  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  33.04 
 
 
448 aa  140  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1765  metal dependent phosphohydrolase  28.01 
 
 
436 aa  139  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286355  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  38.73 
 
 
635 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  35.65 
 
 
461 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  35.65 
 
 
461 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2752  metal-dependent phosphohydrolase  33.63 
 
 
456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204771  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0908  metal dependent phosphohydrolase  27.02 
 
 
416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00247185  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0886  metal dependent phosphohydrolase  27.99 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00322853  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0208  metal dependent phosphohydrolase  38.01 
 
 
229 aa  127  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  42.26 
 
 
428 aa  126  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  29.88 
 
 
403 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  39.77 
 
 
414 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  43.92 
 
 
467 aa  124  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 
428 aa  123  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0387  metal dependent phosphohydrolase  28.32 
 
 
454 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  34.09 
 
 
460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  37.22 
 
 
876 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0772  metal dependent phosphohydrolase  28.14 
 
 
408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  40.82 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  39.1 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  36.63 
 
 
545 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  39.24 
 
 
339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  34.81 
 
 
647 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  32.71 
 
 
516 aa  113  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  37.58 
 
 
470 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1151  metal dependent phosphohydrolase  38.31 
 
 
248 aa  113  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  34.48 
 
 
334 aa  112  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3285  response regulator receiver  28.12 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  38.85 
 
 
636 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.41 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  40.4 
 
 
770 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2306  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
531 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  34.58 
 
 
539 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  34.18 
 
 
647 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 
654 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  37.18 
 
 
518 aa  111  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.95 
 
 
328 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  35.85 
 
 
561 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  36.94 
 
 
453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  40.76 
 
 
405 aa  110  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0659  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 
417 aa  110  7.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000407587  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  33.68 
 
 
648 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  38.61 
 
 
868 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1406  response regulator  35.79 
 
 
351 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  38.16 
 
 
389 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  38.32 
 
 
369 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  38.19 
 
 
177 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 
390 aa  108  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  39.6 
 
 
547 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  35.83 
 
 
362 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  39.6 
 
 
547 aa  107  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1705  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 
471 aa  107  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  35.56 
 
 
371 aa  106  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0860  response regulator  34.91 
 
 
339 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  33.92 
 
 
760 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2833  metal dependent phosphohydrolase  38.26 
 
 
379 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0209293  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0492  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.82 
 
 
508 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0844408  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3001  metal dependent phosphohydrolase  33.74 
 
 
420 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0899  hypothetical protein  35.03 
 
 
294 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000973065 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 
450 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  36.77 
 
 
632 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2545  metal dependent phosphohydrolase  39.58 
 
 
269 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  35.86 
 
 
611 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  32.91 
 
 
505 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  37.66 
 
 
424 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1099  metal dependent phosphohydrolase  36.9 
 
 
572 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00025429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 
351 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0261  metal dependent phosphohydrolase  34.18 
 
 
245 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
574 aa  103  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1158  metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 
314 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.395393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>