More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1338 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1338  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
451 aa  889    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.427381 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2016  metal dependent phosphohydrolase  63.34 
 
 
421 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  38.72 
 
 
424 aa  307  3e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  45.17 
 
 
420 aa  289  8e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0297  metal dependent phosphohydrolase  35.83 
 
 
432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309818  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0194  metal dependent phosphohydrolase  35.63 
 
 
428 aa  254  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0891  metal dependent phosphohydrolase  37.53 
 
 
439 aa  252  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  38.5 
 
 
418 aa  246  9e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0697  metal dependent phosphohydrolase  36.71 
 
 
434 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0009  metal dependent phosphohydrolase  33 
 
 
405 aa  223  8e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1640  metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 
471 aa  222  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2407  HD domain-containing protein  35.31 
 
 
415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00855664  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  36.96 
 
 
420 aa  220  5e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  31.65 
 
 
417 aa  202  9e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2855  HDIG  34.61 
 
 
415 aa  202  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2563  metal dependent phosphohydrolase  33.67 
 
 
422 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30647  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  35.43 
 
 
431 aa  194  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  31.32 
 
 
392 aa  192  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  32.16 
 
 
425 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 
422 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0342  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 
389 aa  186  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  32.46 
 
 
422 aa  186  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  32.9 
 
 
422 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  31.59 
 
 
434 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 
407 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  32.38 
 
 
421 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  27.94 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 
400 aa  169  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1765  metal dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 
436 aa  168  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  29.39 
 
 
347 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0908  metal dependent phosphohydrolase  27.25 
 
 
416 aa  152  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00247185  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  29.9 
 
 
448 aa  152  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2325  metal dependent phosphohydrolase  29.46 
 
 
419 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  40.71 
 
 
450 aa  150  6e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0772  metal dependent phosphohydrolase  28.97 
 
 
408 aa  149  7e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0387  metal dependent phosphohydrolase  31.66 
 
 
454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0886  metal dependent phosphohydrolase  27.91 
 
 
416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00322853  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0659  metal dependent phosphohydrolase  28.9 
 
 
417 aa  147  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000407587  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  47.31 
 
 
461 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  47.31 
 
 
461 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  37.57 
 
 
424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2752  metal-dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 
456 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204771  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  27.19 
 
 
460 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 
428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  41.07 
 
 
428 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 
387 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.39 
 
 
508 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.63 
 
 
513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  40.48 
 
 
339 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  41.88 
 
 
499 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  42.33 
 
 
516 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  40.68 
 
 
389 aa  129  9.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  41.83 
 
 
539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  33.67 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 
518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  37.66 
 
 
470 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  41.61 
 
 
615 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  41.08 
 
 
654 aa  126  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  34.94 
 
 
401 aa  126  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.55 
 
 
328 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.32 
 
 
526 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
467 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  37.57 
 
 
407 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  35.8 
 
 
446 aa  125  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.38 
 
 
364 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3421  putative PAS/PAC sensor protein  42.77 
 
 
341 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3169  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.28 
 
 
353 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821118  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.11 
 
 
491 aa  123  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3024  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
363 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433593  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.07 
 
 
347 aa  123  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  38.31 
 
 
177 aa  123  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  39.88 
 
 
465 aa  123  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  37.21 
 
 
760 aa  123  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.46 
 
 
351 aa  123  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3114  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 
523 aa  122  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00390297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  44.38 
 
 
649 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
698 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1705  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.51 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0306  metal dependent phosphohydrolase  38.02 
 
 
361 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  45 
 
 
635 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  42.2 
 
 
474 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  41.43 
 
 
1073 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.78 
 
 
331 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  40.54 
 
 
481 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  41.5 
 
 
618 aa  121  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.38 
 
 
487 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  45.58 
 
 
550 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  44.59 
 
 
619 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  45.51 
 
 
574 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.44 
 
 
480 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0497  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 
432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2247  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.13 
 
 
518 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.77168  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0838  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.22 
 
 
378 aa  120  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  42.45 
 
 
713 aa  120  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1183  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.86 
 
 
363 aa  120  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  40.85 
 
 
553 aa  120  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  41.43 
 
 
350 aa  120  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  34.71 
 
 
417 aa  120  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  33.71 
 
 
545 aa  120  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.43 
 
 
506 aa  120  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>