More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0009 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0009  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 405 aa  836    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  45.27 
 
 		 420 aa  362  8e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0297  metal dependent phosphohydrolase  42.31 
 
 		 432 aa  325  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2407  HD domain-containing protein  39.74 
 
 		 415 aa  301  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00855664  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  41.03 
 
 		 424 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0891  metal dependent phosphohydrolase  38.02 
 
 		 439 aa  266  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1640  metal dependent phosphohydrolase  35.57 
 
 		 471 aa  254  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0194  metal dependent phosphohydrolase  37.81 
 
 		 428 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2855  HDIG  35.16 
 
 		 415 aa  247  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0697  metal dependent phosphohydrolase  34.36 
 
 		 434 aa  245  9e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  37.53 
 
 		 417 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  36.29 
 
 		 392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  33.86 
 
 		 418 aa  232  9e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2563  metal dependent phosphohydrolase  36.04 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30647  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  36.99 
 
 		 347 aa  231  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 		 403 aa  219  8.999999999999998e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  32.65 
 
 		 407 aa  210  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1338  metal dependent phosphohydrolase  33 
 
 		 451 aa  210  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.427381 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2016  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 421 aa  209  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  30.27 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  32.41 
 
 		 434 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  31.6 
 
 		 421 aa  206  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  31.89 
 
 		 422 aa  202  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  31.99 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  31.99 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  31.65 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 		 420 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  30.11 
 
 		 450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0342  metal dependent phosphohydrolase  33.78 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  31.12 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 		 461 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 		 461 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2752  metal-dependent phosphohydrolase  28.9 
 
 		 456 aa  166  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204771  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0387  metal dependent phosphohydrolase  30.93 
 
 		 454 aa  157  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  27.1 
 
 		 525 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  27.88 
 
 		 460 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  25.98 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0908  metal dependent phosphohydrolase  30.4 
 
 		 416 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00247185  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0886  metal dependent phosphohydrolase  29.72 
 
 		 416 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00322853  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0772  metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0208  metal dependent phosphohydrolase  43.71 
 
 		 229 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3826  transcriptional regulator, LuxR family  30.79 
 
 		 519 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  42.31 
 
 		 539 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  28.24 
 
 		 516 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  39.62 
 
 		 713 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  39.63 
 
 		 611 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2306  metal dependent phosphohydrolase  42.47 
 
 		 531 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  38.86 
 
 		 1073 aa  126  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 545 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  35.5 
 
 		 446 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  41.56 
 
 		 1171 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1705  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.85 
 
 		 471 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  39.22 
 
 		 698 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  37.43 
 
 		 635 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.93 
 
 		 496 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3310  regulatory protein, LuxR  24.94 
 
 		 512 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  39.22 
 
 		 710 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  37.79 
 
 		 428 aa  122  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2574  response regulator  35.75 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0659  metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000407587  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1200  metal dependent phosphohydrolase  38.69 
 
 		 203 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65438  normal  0.101307 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  38.55 
 
 		 574 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 177 aa  121  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  37.57 
 
 		 414 aa  121  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  39.74 
 
 		 509 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  38.51 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  38.69 
 
 		 650 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  37.21 
 
 		 428 aa  121  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.29 
 
 		 328 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1765  metal dependent phosphohydrolase  38.27 
 
 		 436 aa  120  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  39.04 
 
 		 495 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 		 487 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  38.6 
 
 		 407 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  36.59 
 
 		 470 aa  119  7e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  38.96 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  41.03 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  33.71 
 
 		 547 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  33.71 
 
 		 547 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1151  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 		 248 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505397  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  37.09 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  39.64 
 
 		 649 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  36.51 
 
 		 499 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4288  metal dependent phosphohydrolase  25.93 
 
 		 519 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.472516  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  35.59 
 
 		 465 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  38.62 
 
 		 424 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  34.03 
 
 		 654 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  37.11 
 
 		 561 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2138  metal dependent phosphohydrolase  37.08 
 
 		 606 aa  117  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.258694  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3165  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.93 
 
 		 367 aa  117  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0569095  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0306  metal dependent phosphohydrolase  38.07 
 
 		 361 aa  116  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  33.33 
 
 		 876 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 		 647 aa  116  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1546  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.43 
 
 		 368 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3024  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.67 
 
 		 363 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433593  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.21 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 		 647 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  34.83 
 
 		 467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3563  metal dependent phosphohydrolase  35.52 
 
 		 205 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.3 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>