More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2505 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2505  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 610 aa  1239    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1511  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.39 
 
 		 557 aa  127  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00005186  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.88 
 
 		 550 aa  126  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1885  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.18 
 
 		 558 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  42.68 
 
 		 424 aa  124  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0859  metal dependent phosphohydrolase  39.29 
 
 		 685 aa  120  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.55284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  42.68 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  38.96 
 
 		 547 aa  117  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  38.96 
 
 		 547 aa  117  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  30.26 
 
 		 509 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.2 
 
 		 351 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  36.2 
 
 		 649 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  39.74 
 
 		 339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2111  metal dependent phosphohydrolase  40.4 
 
 		 201 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  42.95 
 
 		 545 aa  115  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3285  response regulator receiver  41.29 
 
 		 362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1152  metal dependent phosphohydrolase  30.14 
 
 		 565 aa  114  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000790776  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0109  diguanylate cyclase  32.07 
 
 		 461 aa  114  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.91 
 
 		 364 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0891  metal dependent phosphohydrolase  33.01 
 
 		 439 aa  113  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  36.71 
 
 		 1171 aa  113  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0978  metal dependent phosphohydrolase  38.51 
 
 		 558 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000628602  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1406  response regulator  38.55 
 
 		 351 aa  111  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2655  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  39.75 
 
 		 353 aa  111  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.18 
 
 		 367 aa  112  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  38.93 
 
 		 611 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1476  diguanylate cyclase  39.77 
 
 		 414 aa  111  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.64785  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2407  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.48 
 
 		 758 aa  111  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  37.89 
 
 		 331 aa  111  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  35.58 
 
 		 650 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  38.61 
 
 		 177 aa  110  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2545  metal dependent phosphohydrolase  37.2 
 
 		 269 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1484  diguanylate cyclase  38.25 
 
 		 615 aa  110  8.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  39.35 
 
 		 648 aa  110  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  38.06 
 
 		 469 aa  110  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0383  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.57 
 
 		 746 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  32.86 
 
 		 334 aa  110  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4913  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.47 
 
 		 354 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2574  response regulator  35.37 
 
 		 368 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4449  metal-dependent phosphohydrolase  39.47 
 
 		 358 aa  110  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.508967 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  35.05 
 
 		 268 aa  109  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0504  metal dependent phosphohydrolase  36.94 
 
 		 196 aa  109  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 		 574 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4963  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.07 
 
 		 350 aa  110  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102256  normal  0.0892849 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3239  metal dependent phosphohydrolase  40.82 
 
 		 421 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  39.87 
 
 		 197 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2800  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.82 
 
 		 573 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1236  metal dependent phosphohydrolase  38.16 
 
 		 574 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0497288  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3096  metal dependent phosphohydrolase  40.82 
 
 		 421 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.789641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  39.38 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.29 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1002  metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 		 560 aa  109  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.1679  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3086  metal dependent phosphohydrolase  40.82 
 
 		 421 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.688804  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  32.52 
 
 		 403 aa  108  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2366  response regulator  37.89 
 
 		 525 aa  108  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0206  metal-dependent phosphohydrolase  38.06 
 
 		 369 aa  108  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0150  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.06 
 
 		 369 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2833  metal dependent phosphohydrolase  35.95 
 
 		 379 aa  108  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0209293  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0297  metal dependent phosphohydrolase  38.61 
 
 		 432 aa  108  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1281  metal dependent phosphohydrolase  40.82 
 
 		 421 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.246487 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.34 
 
 		 853 aa  108  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  35.37 
 
 		 436 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  35.46 
 
 		 619 aa  108  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1470  metal dependent phosphohydrolase  34.36 
 
 		 257 aa  108  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.97 
 
 		 345 aa  108  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2138  metal dependent phosphohydrolase  37.82 
 
 		 606 aa  108  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.258694  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  34.12 
 
 		 498 aa  108  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.76 
 
 		 971 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1834  diguanylate cyclase  28.98 
 
 		 525 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.245567  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  30.6 
 
 		 561 aa  107  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  31.14 
 
 		 334 aa  107  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1471  diguanylate cyclase  28.33 
 
 		 439 aa  107  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0319  diguanylate cyclase  35.68 
 
 		 732 aa  107  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4485  hypothetical protein  36.02 
 
 		 523 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2199  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 		 523 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.179718  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  34.81 
 
 		 771 aa  107  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  38.96 
 
 		 453 aa  107  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  38.85 
 
 		 418 aa  107  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2004  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.89 
 
 		 525 aa  107  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0562345  hitchhiker  0.000000282251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1971  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.89 
 
 		 525 aa  107  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0825869  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  33.69 
 
 		 392 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2222  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 		 523 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.151758  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2172  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 		 523 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0465103  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  31.93 
 
 		 308 aa  106  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0715  diguanylate cyclase  37.36 
 
 		 516 aa  106  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.83 
 
 		 664 aa  106  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1099  metal dependent phosphohydrolase  34.87 
 
 		 572 aa  106  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00025429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3082  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.42 
 
 		 550 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000925788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2105  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.87 
 
 		 525 aa  106  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00173233  normal  0.407049 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2212  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 		 523 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.16257  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5913  diguanylate cyclase  39.52 
 
 		 364 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  39.29 
 
 		 417 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1387  HD domain-containing protein  39.52 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  30.67 
 
 		 1237 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3835  diguanylate cyclase  36.52 
 
 		 316 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  33.77 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.74 
 
 		 668 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  25.89 
 
 		 663 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>